Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTX1

NDC1, Nucleoporin NDC1, humanhuman

Predictions only

Length 674 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDC1Q9BTX1 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
NDC1Q9BTX1 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NDC1Q9BTX1 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NDC1Q9BTX1 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NDC1Q9BTX1 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NDC1Q9BTX1 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
NDC1Q9BTX1 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NDC1Q9BTX1 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NDC1Q9BTX1 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NDC1Q9BTX1 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NDC1Q9BTX1 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NDC1Q9BTX1 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NDC1Q9BTX1 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NDC1Q9BTX1 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NDC1Q9BTX1 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NDC1Q9BTX1 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NDC1Q9BTX1 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NDC1Q9BTX1 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
NDC1Q9BTX1 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NDC1Q9BTX1 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NDC1Q9BTX1 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NDC1Q9BTX1 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
NDC1Q9BTX1 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NDC1Q9BTX1 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NDC1Q9BTX1 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NDC1Q9BTX1 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NDC1Q9BTX1 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NDC1Q9BTX1 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NDC1Q9BTX1 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NDC1Q9BTX1 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NDC1Q9BTX1 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NDC1Q9BTX1 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NDC1Q9BTX1 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NDC1Q9BTX1 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NDC1Q9BTX1 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NDC1Q9BTX1 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NDC1Q9BTX1 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NDC1Q9BTX1 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NDC1Q9BTX1 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NDC1Q9BTX1 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NDC1Q9BTX1 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NDC1Q9BTX1 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NDC1Q9BTX1 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NDC1Q9BTX1 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
NDC1Q9BTX1 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NDC1Q9BTX1 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NDC1Q9BTX1 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NDC1Q9BTX1 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NDC1Q9BTX1 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NDC1Q9BTX1 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NDC1Q9BTX1 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NDC1Q9BTX1 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NDC1Q9BTX1 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NDC1Q9BTX1 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NDC1Q9BTX1 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NDC1Q9BTX1 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NDC1Q9BTX1 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NDC1Q9BTX1 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NDC1Q9BTX1 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NDC1Q9BTX1 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NDC1Q9BTX1 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NDC1Q9BTX1 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NDC1Q9BTX1 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NDC1Q9BTX1 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
NDC1Q9BTX1 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NDC1Q9BTX1 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
NDC1Q9BTX1 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NDC1Q9BTX1 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NDC1Q9BTX1 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NDC1Q9BTX1 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
NDC1Q9BTX1 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NDC1Q9BTX1 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NDC1Q9BTX1 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NDC1Q9BTX1 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NDC1Q9BTX1 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NDC1Q9BTX1 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NDC1Q9BTX1 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NDC1Q9BTX1 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NDC1Q9BTX1 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NDC1Q9BTX1 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NDC1Q9BTX1 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NDC1Q9BTX1 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NDC1Q9BTX1 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NDC1Q9BTX1 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NDC1Q9BTX1 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
NDC1Q9BTX1 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NDC1Q9BTX1 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NDC1Q9BTX1 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
NDC1Q9BTX1 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NDC1Q9BTX1 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NDC1Q9BTX1 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NDC1Q9BTX1 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NDC1Q9BTX1 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NDC1Q9BTX1 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NDC1Q9BTX1 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NDC1Q9BTX1 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NDC1Q9BTX1 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NDC1Q9BTX1 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NDC1Q9BTX1 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NDC1Q9BTX1 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms