Protein–RNA interactions for Protein: Q99467

CD180, CD180 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD180Q99467 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CD180Q99467 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CD180Q99467 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CD180Q99467 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CD180Q99467 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CD180Q99467 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CD180Q99467 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CD180Q99467 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CD180Q99467 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CD180Q99467 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CD180Q99467 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CD180Q99467 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CD180Q99467 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CD180Q99467 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CD180Q99467 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CD180Q99467 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CD180Q99467 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CD180Q99467 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CD180Q99467 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CD180Q99467 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CD180Q99467 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CD180Q99467 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CD180Q99467 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CD180Q99467 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
CD180Q99467 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CD180Q99467 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CD180Q99467 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CD180Q99467 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CD180Q99467 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CD180Q99467 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CD180Q99467 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CD180Q99467 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CD180Q99467 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CD180Q99467 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CD180Q99467 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CD180Q99467 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CD180Q99467 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CD180Q99467 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CD180Q99467 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CD180Q99467 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CD180Q99467 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CD180Q99467 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CD180Q99467 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CD180Q99467 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CD180Q99467 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CD180Q99467 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CD180Q99467 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CD180Q99467 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CD180Q99467 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CD180Q99467 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CD180Q99467 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CD180Q99467 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CD180Q99467 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CD180Q99467 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CD180Q99467 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CD180Q99467 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CD180Q99467 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CD180Q99467 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CD180Q99467 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CD180Q99467 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CD180Q99467 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CD180Q99467 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CD180Q99467 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CD180Q99467 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CD180Q99467 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CD180Q99467 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CD180Q99467 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CD180Q99467 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CD180Q99467 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CD180Q99467 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CD180Q99467 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CD180Q99467 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CD180Q99467 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CD180Q99467 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CD180Q99467 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CD180Q99467 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CD180Q99467 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CD180Q99467 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CD180Q99467 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CD180Q99467 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CD180Q99467 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CD180Q99467 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CD180Q99467 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CD180Q99467 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CD180Q99467 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CD180Q99467 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CD180Q99467 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CD180Q99467 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CD180Q99467 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CD180Q99467 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CD180Q99467 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CD180Q99467 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CD180Q99467 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CD180Q99467 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CD180Q99467 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CD180Q99467 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CD180Q99467 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CD180Q99467 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CD180Q99467 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CD180Q99467 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms