Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD4

TRIM47, Tripartite motif-containing protein 47, humanhuman

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM47Q96LD4 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
TRIM47Q96LD4 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
TRIM47Q96LD4 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
TRIM47Q96LD4 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
TRIM47Q96LD4 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
TRIM47Q96LD4 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
TRIM47Q96LD4 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
TRIM47Q96LD4 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
TRIM47Q96LD4 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
TRIM47Q96LD4 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
TRIM47Q96LD4 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
TRIM47Q96LD4 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
TRIM47Q96LD4 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
TRIM47Q96LD4 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
TRIM47Q96LD4 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
TRIM47Q96LD4 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
TRIM47Q96LD4 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
TRIM47Q96LD4 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
TRIM47Q96LD4 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
TRIM47Q96LD4 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC30■■■□□ 2.39
TRIM47Q96LD4 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
TRIM47Q96LD4 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
TRIM47Q96LD4 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
TRIM47Q96LD4 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
TRIM47Q96LD4 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
TRIM47Q96LD4 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
TRIM47Q96LD4 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
TRIM47Q96LD4 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
TRIM47Q96LD4 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
TRIM47Q96LD4 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
TRIM47Q96LD4 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
TRIM47Q96LD4 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
TRIM47Q96LD4 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
TRIM47Q96LD4 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
TRIM47Q96LD4 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
TRIM47Q96LD4 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
TRIM47Q96LD4 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
TRIM47Q96LD4 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
TRIM47Q96LD4 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
TRIM47Q96LD4 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
TRIM47Q96LD4 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
TRIM47Q96LD4 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
TRIM47Q96LD4 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
TRIM47Q96LD4 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
TRIM47Q96LD4 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
TRIM47Q96LD4 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
TRIM47Q96LD4 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
TRIM47Q96LD4 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
TRIM47Q96LD4 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
TRIM47Q96LD4 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
TRIM47Q96LD4 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
TRIM47Q96LD4 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
TRIM47Q96LD4 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
TRIM47Q96LD4 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
TRIM47Q96LD4 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC29.89■■■□□ 2.38
TRIM47Q96LD4 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
TRIM47Q96LD4 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
TRIM47Q96LD4 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
TRIM47Q96LD4 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
TRIM47Q96LD4 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
TRIM47Q96LD4 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
TRIM47Q96LD4 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
TRIM47Q96LD4 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
TRIM47Q96LD4 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
TRIM47Q96LD4 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
TRIM47Q96LD4 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
TRIM47Q96LD4 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
TRIM47Q96LD4 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
TRIM47Q96LD4 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
TRIM47Q96LD4 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
TRIM47Q96LD4 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
TRIM47Q96LD4 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
TRIM47Q96LD4 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
TRIM47Q96LD4 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
TRIM47Q96LD4 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
TRIM47Q96LD4 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
TRIM47Q96LD4 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
TRIM47Q96LD4 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
TRIM47Q96LD4 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
TRIM47Q96LD4 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
TRIM47Q96LD4 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
TRIM47Q96LD4 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
TRIM47Q96LD4 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
TRIM47Q96LD4 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
TRIM47Q96LD4 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
TRIM47Q96LD4 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
TRIM47Q96LD4 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
TRIM47Q96LD4 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
TRIM47Q96LD4 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
TRIM47Q96LD4 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
TRIM47Q96LD4 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
TRIM47Q96LD4 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
TRIM47Q96LD4 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
TRIM47Q96LD4 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
TRIM47Q96LD4 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
TRIM47Q96LD4 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
TRIM47Q96LD4 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
TRIM47Q96LD4 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
TRIM47Q96LD4 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
TRIM47Q96LD4 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms