Protein–RNA interactions for Protein: Q96CX3

ZNF501, Zinc finger protein 501, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF501Q96CX3 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF501Q96CX3 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF501Q96CX3 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF501Q96CX3 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF501Q96CX3 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF501Q96CX3 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF501Q96CX3 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF501Q96CX3 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZNF501Q96CX3 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZNF501Q96CX3 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
ZNF501Q96CX3 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNF501Q96CX3 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNF501Q96CX3 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNF501Q96CX3 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNF501Q96CX3 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNF501Q96CX3 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNF501Q96CX3 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNF501Q96CX3 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNF501Q96CX3 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNF501Q96CX3 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNF501Q96CX3 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNF501Q96CX3 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNF501Q96CX3 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNF501Q96CX3 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNF501Q96CX3 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNF501Q96CX3 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNF501Q96CX3 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZNF501Q96CX3 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZNF501Q96CX3 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZNF501Q96CX3 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNF501Q96CX3 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNF501Q96CX3 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNF501Q96CX3 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNF501Q96CX3 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNF501Q96CX3 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNF501Q96CX3 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZNF501Q96CX3 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZNF501Q96CX3 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZNF501Q96CX3 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZNF501Q96CX3 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZNF501Q96CX3 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
ZNF501Q96CX3 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZNF501Q96CX3 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNF501Q96CX3 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNF501Q96CX3 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNF501Q96CX3 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNF501Q96CX3 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZNF501Q96CX3 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZNF501Q96CX3 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
ZNF501Q96CX3 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZNF501Q96CX3 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZNF501Q96CX3 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ZNF501Q96CX3 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ZNF501Q96CX3 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ZNF501Q96CX3 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ZNF501Q96CX3 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ZNF501Q96CX3 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ZNF501Q96CX3 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ZNF501Q96CX3 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZNF501Q96CX3 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZNF501Q96CX3 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZNF501Q96CX3 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNF501Q96CX3 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNF501Q96CX3 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNF501Q96CX3 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNF501Q96CX3 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF501Q96CX3 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF501Q96CX3 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF501Q96CX3 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNF501Q96CX3 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNF501Q96CX3 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNF501Q96CX3 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNF501Q96CX3 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNF501Q96CX3 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNF501Q96CX3 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZNF501Q96CX3 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZNF501Q96CX3 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZNF501Q96CX3 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZNF501Q96CX3 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZNF501Q96CX3 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZNF501Q96CX3 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNF501Q96CX3 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNF501Q96CX3 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNF501Q96CX3 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNF501Q96CX3 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZNF501Q96CX3 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZNF501Q96CX3 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZNF501Q96CX3 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZNF501Q96CX3 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZNF501Q96CX3 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZNF501Q96CX3 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZNF501Q96CX3 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZNF501Q96CX3 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZNF501Q96CX3 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZNF501Q96CX3 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNF501Q96CX3 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNF501Q96CX3 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNF501Q96CX3 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNF501Q96CX3 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNF501Q96CX3 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115.1 ms