Protein–RNA interactions for Protein: Q96BD6

SPSB1, SPRY domain-containing SOCS box protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPSB1Q96BD6 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPSB1Q96BD6 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPSB1Q96BD6 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPSB1Q96BD6 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SPSB1Q96BD6 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SPSB1Q96BD6 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SPSB1Q96BD6 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SPSB1Q96BD6 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SPSB1Q96BD6 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SPSB1Q96BD6 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SPSB1Q96BD6 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SPSB1Q96BD6 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SPSB1Q96BD6 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SPSB1Q96BD6 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SPSB1Q96BD6 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SPSB1Q96BD6 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SPSB1Q96BD6 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SPSB1Q96BD6 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SPSB1Q96BD6 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SPSB1Q96BD6 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SPSB1Q96BD6 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SPSB1Q96BD6 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SPSB1Q96BD6 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SPSB1Q96BD6 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SPSB1Q96BD6 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SPSB1Q96BD6 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SPSB1Q96BD6 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SPSB1Q96BD6 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SPSB1Q96BD6 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SPSB1Q96BD6 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SPSB1Q96BD6 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SPSB1Q96BD6 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SPSB1Q96BD6 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SPSB1Q96BD6 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SPSB1Q96BD6 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SPSB1Q96BD6 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SPSB1Q96BD6 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SPSB1Q96BD6 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SPSB1Q96BD6 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SPSB1Q96BD6 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SPSB1Q96BD6 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
SPSB1Q96BD6 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SPSB1Q96BD6 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SPSB1Q96BD6 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SPSB1Q96BD6 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SPSB1Q96BD6 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SPSB1Q96BD6 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SPSB1Q96BD6 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SPSB1Q96BD6 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SPSB1Q96BD6 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SPSB1Q96BD6 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SPSB1Q96BD6 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SPSB1Q96BD6 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SPSB1Q96BD6 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SPSB1Q96BD6 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SPSB1Q96BD6 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SPSB1Q96BD6 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SPSB1Q96BD6 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SPSB1Q96BD6 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SPSB1Q96BD6 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SPSB1Q96BD6 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SPSB1Q96BD6 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SPSB1Q96BD6 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SPSB1Q96BD6 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SPSB1Q96BD6 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SPSB1Q96BD6 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SPSB1Q96BD6 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SPSB1Q96BD6 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SPSB1Q96BD6 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SPSB1Q96BD6 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SPSB1Q96BD6 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SPSB1Q96BD6 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SPSB1Q96BD6 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SPSB1Q96BD6 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
SPSB1Q96BD6 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SPSB1Q96BD6 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SPSB1Q96BD6 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SPSB1Q96BD6 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SPSB1Q96BD6 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SPSB1Q96BD6 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
SPSB1Q96BD6 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
SPSB1Q96BD6 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SPSB1Q96BD6 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SPSB1Q96BD6 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SPSB1Q96BD6 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SPSB1Q96BD6 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SPSB1Q96BD6 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SPSB1Q96BD6 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SPSB1Q96BD6 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SPSB1Q96BD6 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SPSB1Q96BD6 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SPSB1Q96BD6 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SPSB1Q96BD6 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SPSB1Q96BD6 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SPSB1Q96BD6 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SPSB1Q96BD6 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SPSB1Q96BD6 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SPSB1Q96BD6 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
SPSB1Q96BD6 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
SPSB1Q96BD6 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.2 ms