Protein–RNA interactions for Protein: Q8TF42

UBASH3B, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein B, humanhuman

Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBASH3BQ8TF42 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
UBASH3BQ8TF42 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
UBASH3BQ8TF42 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
UBASH3BQ8TF42 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
UBASH3BQ8TF42 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
UBASH3BQ8TF42 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
UBASH3BQ8TF42 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
UBASH3BQ8TF42 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
UBASH3BQ8TF42 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
UBASH3BQ8TF42 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
UBASH3BQ8TF42 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
UBASH3BQ8TF42 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
UBASH3BQ8TF42 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
UBASH3BQ8TF42 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
UBASH3BQ8TF42 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBASH3BQ8TF42 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBASH3BQ8TF42 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBASH3BQ8TF42 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
UBASH3BQ8TF42 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
UBASH3BQ8TF42 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
UBASH3BQ8TF42 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
UBASH3BQ8TF42 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
UBASH3BQ8TF42 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
UBASH3BQ8TF42 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
UBASH3BQ8TF42 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
UBASH3BQ8TF42 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
UBASH3BQ8TF42 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBASH3BQ8TF42 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBASH3BQ8TF42 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBASH3BQ8TF42 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBASH3BQ8TF42 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBASH3BQ8TF42 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBASH3BQ8TF42 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBASH3BQ8TF42 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBASH3BQ8TF42 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBASH3BQ8TF42 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBASH3BQ8TF42 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBASH3BQ8TF42 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBASH3BQ8TF42 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBASH3BQ8TF42 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBASH3BQ8TF42 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBASH3BQ8TF42 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBASH3BQ8TF42 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBASH3BQ8TF42 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBASH3BQ8TF42 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBASH3BQ8TF42 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBASH3BQ8TF42 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBASH3BQ8TF42 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBASH3BQ8TF42 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBASH3BQ8TF42 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBASH3BQ8TF42 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBASH3BQ8TF42 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBASH3BQ8TF42 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBASH3BQ8TF42 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBASH3BQ8TF42 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBASH3BQ8TF42 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBASH3BQ8TF42 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBASH3BQ8TF42 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBASH3BQ8TF42 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBASH3BQ8TF42 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBASH3BQ8TF42 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBASH3BQ8TF42 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBASH3BQ8TF42 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBASH3BQ8TF42 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBASH3BQ8TF42 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBASH3BQ8TF42 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBASH3BQ8TF42 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBASH3BQ8TF42 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBASH3BQ8TF42 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBASH3BQ8TF42 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBASH3BQ8TF42 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBASH3BQ8TF42 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBASH3BQ8TF42 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBASH3BQ8TF42 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBASH3BQ8TF42 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBASH3BQ8TF42 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBASH3BQ8TF42 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBASH3BQ8TF42 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBASH3BQ8TF42 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBASH3BQ8TF42 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBASH3BQ8TF42 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBASH3BQ8TF42 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBASH3BQ8TF42 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBASH3BQ8TF42 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBASH3BQ8TF42 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBASH3BQ8TF42 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBASH3BQ8TF42 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBASH3BQ8TF42 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBASH3BQ8TF42 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBASH3BQ8TF42 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBASH3BQ8TF42 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBASH3BQ8TF42 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBASH3BQ8TF42 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBASH3BQ8TF42 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBASH3BQ8TF42 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBASH3BQ8TF42 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBASH3BQ8TF42 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBASH3BQ8TF42 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBASH3BQ8TF42 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBASH3BQ8TF42 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms