Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCL9

APCDD1L, Protein APCDD1-like, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APCDD1LQ8NCL9 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
APCDD1LQ8NCL9 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
APCDD1LQ8NCL9 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
APCDD1LQ8NCL9 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
APCDD1LQ8NCL9 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
APCDD1LQ8NCL9 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
APCDD1LQ8NCL9 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
APCDD1LQ8NCL9 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
APCDD1LQ8NCL9 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
APCDD1LQ8NCL9 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
APCDD1LQ8NCL9 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
APCDD1LQ8NCL9 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
APCDD1LQ8NCL9 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
APCDD1LQ8NCL9 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
APCDD1LQ8NCL9 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
APCDD1LQ8NCL9 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
APCDD1LQ8NCL9 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
APCDD1LQ8NCL9 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
APCDD1LQ8NCL9 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
APCDD1LQ8NCL9 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
APCDD1LQ8NCL9 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
APCDD1LQ8NCL9 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
APCDD1LQ8NCL9 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
APCDD1LQ8NCL9 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
APCDD1LQ8NCL9 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
APCDD1LQ8NCL9 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
APCDD1LQ8NCL9 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
APCDD1LQ8NCL9 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
APCDD1LQ8NCL9 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
APCDD1LQ8NCL9 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
APCDD1LQ8NCL9 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
APCDD1LQ8NCL9 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
APCDD1LQ8NCL9 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
APCDD1LQ8NCL9 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
APCDD1LQ8NCL9 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
APCDD1LQ8NCL9 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
APCDD1LQ8NCL9 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
APCDD1LQ8NCL9 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
APCDD1LQ8NCL9 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
APCDD1LQ8NCL9 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
APCDD1LQ8NCL9 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
APCDD1LQ8NCL9 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
APCDD1LQ8NCL9 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
APCDD1LQ8NCL9 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
APCDD1LQ8NCL9 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
APCDD1LQ8NCL9 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
APCDD1LQ8NCL9 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
APCDD1LQ8NCL9 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
APCDD1LQ8NCL9 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
APCDD1LQ8NCL9 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
APCDD1LQ8NCL9 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
APCDD1LQ8NCL9 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
APCDD1LQ8NCL9 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
APCDD1LQ8NCL9 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
APCDD1LQ8NCL9 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
APCDD1LQ8NCL9 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
APCDD1LQ8NCL9 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
APCDD1LQ8NCL9 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
APCDD1LQ8NCL9 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
APCDD1LQ8NCL9 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
APCDD1LQ8NCL9 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
APCDD1LQ8NCL9 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
APCDD1LQ8NCL9 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
APCDD1LQ8NCL9 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
APCDD1LQ8NCL9 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
APCDD1LQ8NCL9 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
APCDD1LQ8NCL9 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
APCDD1LQ8NCL9 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
APCDD1LQ8NCL9 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
APCDD1LQ8NCL9 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
APCDD1LQ8NCL9 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
APCDD1LQ8NCL9 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
APCDD1LQ8NCL9 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
APCDD1LQ8NCL9 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
APCDD1LQ8NCL9 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
APCDD1LQ8NCL9 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
APCDD1LQ8NCL9 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
APCDD1LQ8NCL9 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
APCDD1LQ8NCL9 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
APCDD1LQ8NCL9 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
APCDD1LQ8NCL9 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
APCDD1LQ8NCL9 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
APCDD1LQ8NCL9 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
APCDD1LQ8NCL9 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
APCDD1LQ8NCL9 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
APCDD1LQ8NCL9 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
APCDD1LQ8NCL9 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
APCDD1LQ8NCL9 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
APCDD1LQ8NCL9 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
APCDD1LQ8NCL9 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
APCDD1LQ8NCL9 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
APCDD1LQ8NCL9 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
APCDD1LQ8NCL9 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
APCDD1LQ8NCL9 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
APCDD1LQ8NCL9 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
APCDD1LQ8NCL9 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
APCDD1LQ8NCL9 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
APCDD1LQ8NCL9 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
APCDD1LQ8NCL9 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
APCDD1LQ8NCL9 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms