Protein–RNA interactions for Protein: Q8N187

CARF, Calcium-responsive transcription factor, humanhuman

Predictions only

Length 725 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARFQ8N187 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CARFQ8N187 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CARFQ8N187 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CARFQ8N187 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CARFQ8N187 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CARFQ8N187 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CARFQ8N187 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CARFQ8N187 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CARFQ8N187 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CARFQ8N187 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CARFQ8N187 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CARFQ8N187 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CARFQ8N187 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CARFQ8N187 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CARFQ8N187 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CARFQ8N187 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CARFQ8N187 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CARFQ8N187 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CARFQ8N187 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CARFQ8N187 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CARFQ8N187 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CARFQ8N187 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CARFQ8N187 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CARFQ8N187 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CARFQ8N187 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CARFQ8N187 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CARFQ8N187 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CARFQ8N187 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CARFQ8N187 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CARFQ8N187 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CARFQ8N187 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CARFQ8N187 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CARFQ8N187 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CARFQ8N187 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CARFQ8N187 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CARFQ8N187 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CARFQ8N187 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CARFQ8N187 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CARFQ8N187 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CARFQ8N187 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CARFQ8N187 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CARFQ8N187 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CARFQ8N187 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CARFQ8N187 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CARFQ8N187 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CARFQ8N187 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CARFQ8N187 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CARFQ8N187 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CARFQ8N187 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CARFQ8N187 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CARFQ8N187 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CARFQ8N187 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CARFQ8N187 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CARFQ8N187 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CARFQ8N187 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CARFQ8N187 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CARFQ8N187 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CARFQ8N187 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CARFQ8N187 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CARFQ8N187 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CARFQ8N187 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CARFQ8N187 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CARFQ8N187 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CARFQ8N187 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CARFQ8N187 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CARFQ8N187 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CARFQ8N187 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CARFQ8N187 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CARFQ8N187 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CARFQ8N187 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CARFQ8N187 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CARFQ8N187 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CARFQ8N187 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CARFQ8N187 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CARFQ8N187 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CARFQ8N187 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CARFQ8N187 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CARFQ8N187 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CARFQ8N187 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CARFQ8N187 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CARFQ8N187 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CARFQ8N187 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CARFQ8N187 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CARFQ8N187 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CARFQ8N187 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CARFQ8N187 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CARFQ8N187 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CARFQ8N187 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CARFQ8N187 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CARFQ8N187 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CARFQ8N187 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CARFQ8N187 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CARFQ8N187 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CARFQ8N187 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CARFQ8N187 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CARFQ8N187 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CARFQ8N187 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CARFQ8N187 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CARFQ8N187 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CARFQ8N187 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms