Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZ21

PHACTR4, Phosphatase and actin regulator 4, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHACTR4Q8IZ21 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PHACTR4Q8IZ21 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PHACTR4Q8IZ21 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PHACTR4Q8IZ21 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PHACTR4Q8IZ21 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PHACTR4Q8IZ21 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PHACTR4Q8IZ21 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PHACTR4Q8IZ21 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PHACTR4Q8IZ21 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PHACTR4Q8IZ21 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PHACTR4Q8IZ21 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PHACTR4Q8IZ21 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PHACTR4Q8IZ21 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PHACTR4Q8IZ21 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
PHACTR4Q8IZ21 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
PHACTR4Q8IZ21 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PHACTR4Q8IZ21 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PHACTR4Q8IZ21 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
PHACTR4Q8IZ21 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PHACTR4Q8IZ21 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PHACTR4Q8IZ21 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PHACTR4Q8IZ21 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PHACTR4Q8IZ21 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PHACTR4Q8IZ21 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PHACTR4Q8IZ21 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PHACTR4Q8IZ21 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PHACTR4Q8IZ21 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PHACTR4Q8IZ21 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PHACTR4Q8IZ21 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PHACTR4Q8IZ21 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PHACTR4Q8IZ21 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PHACTR4Q8IZ21 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PHACTR4Q8IZ21 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PHACTR4Q8IZ21 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PHACTR4Q8IZ21 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PHACTR4Q8IZ21 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PHACTR4Q8IZ21 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PHACTR4Q8IZ21 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PHACTR4Q8IZ21 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PHACTR4Q8IZ21 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PHACTR4Q8IZ21 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PHACTR4Q8IZ21 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PHACTR4Q8IZ21 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
PHACTR4Q8IZ21 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PHACTR4Q8IZ21 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PHACTR4Q8IZ21 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PHACTR4Q8IZ21 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PHACTR4Q8IZ21 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PHACTR4Q8IZ21 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PHACTR4Q8IZ21 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PHACTR4Q8IZ21 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PHACTR4Q8IZ21 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PHACTR4Q8IZ21 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PHACTR4Q8IZ21 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
PHACTR4Q8IZ21 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PHACTR4Q8IZ21 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PHACTR4Q8IZ21 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PHACTR4Q8IZ21 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PHACTR4Q8IZ21 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
PHACTR4Q8IZ21 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PHACTR4Q8IZ21 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PHACTR4Q8IZ21 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
PHACTR4Q8IZ21 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PHACTR4Q8IZ21 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PHACTR4Q8IZ21 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PHACTR4Q8IZ21 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PHACTR4Q8IZ21 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PHACTR4Q8IZ21 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PHACTR4Q8IZ21 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PHACTR4Q8IZ21 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
PHACTR4Q8IZ21 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PHACTR4Q8IZ21 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PHACTR4Q8IZ21 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PHACTR4Q8IZ21 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PHACTR4Q8IZ21 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PHACTR4Q8IZ21 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PHACTR4Q8IZ21 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PHACTR4Q8IZ21 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PHACTR4Q8IZ21 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PHACTR4Q8IZ21 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PHACTR4Q8IZ21 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PHACTR4Q8IZ21 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PHACTR4Q8IZ21 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PHACTR4Q8IZ21 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PHACTR4Q8IZ21 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PHACTR4Q8IZ21 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PHACTR4Q8IZ21 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PHACTR4Q8IZ21 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PHACTR4Q8IZ21 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PHACTR4Q8IZ21 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PHACTR4Q8IZ21 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PHACTR4Q8IZ21 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PHACTR4Q8IZ21 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PHACTR4Q8IZ21 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PHACTR4Q8IZ21 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PHACTR4Q8IZ21 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PHACTR4Q8IZ21 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PHACTR4Q8IZ21 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PHACTR4Q8IZ21 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PHACTR4Q8IZ21 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms