Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWX8

CHERP, Calcium homeostasis endoplasmic reticulum protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHERPQ8IWX8 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CHERPQ8IWX8 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHERPQ8IWX8 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHERPQ8IWX8 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHERPQ8IWX8 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHERPQ8IWX8 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHERPQ8IWX8 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHERPQ8IWX8 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHERPQ8IWX8 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CHERPQ8IWX8 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CHERPQ8IWX8 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CHERPQ8IWX8 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CHERPQ8IWX8 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CHERPQ8IWX8 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CHERPQ8IWX8 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CHERPQ8IWX8 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CHERPQ8IWX8 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CHERPQ8IWX8 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHERPQ8IWX8 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CHERPQ8IWX8 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CHERPQ8IWX8 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CHERPQ8IWX8 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CHERPQ8IWX8 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CHERPQ8IWX8 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CHERPQ8IWX8 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CHERPQ8IWX8 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CHERPQ8IWX8 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHERPQ8IWX8 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHERPQ8IWX8 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHERPQ8IWX8 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHERPQ8IWX8 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHERPQ8IWX8 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHERPQ8IWX8 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHERPQ8IWX8 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHERPQ8IWX8 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHERPQ8IWX8 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHERPQ8IWX8 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHERPQ8IWX8 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CHERPQ8IWX8 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CHERPQ8IWX8 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CHERPQ8IWX8 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CHERPQ8IWX8 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CHERPQ8IWX8 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CHERPQ8IWX8 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CHERPQ8IWX8 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CHERPQ8IWX8 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHERPQ8IWX8 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHERPQ8IWX8 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHERPQ8IWX8 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHERPQ8IWX8 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHERPQ8IWX8 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CHERPQ8IWX8 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CHERPQ8IWX8 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CHERPQ8IWX8 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CHERPQ8IWX8 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CHERPQ8IWX8 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CHERPQ8IWX8 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CHERPQ8IWX8 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHERPQ8IWX8 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHERPQ8IWX8 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHERPQ8IWX8 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHERPQ8IWX8 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHERPQ8IWX8 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHERPQ8IWX8 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHERPQ8IWX8 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHERPQ8IWX8 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHERPQ8IWX8 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHERPQ8IWX8 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHERPQ8IWX8 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CHERPQ8IWX8 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHERPQ8IWX8 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHERPQ8IWX8 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHERPQ8IWX8 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHERPQ8IWX8 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHERPQ8IWX8 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHERPQ8IWX8 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHERPQ8IWX8 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHERPQ8IWX8 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHERPQ8IWX8 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHERPQ8IWX8 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHERPQ8IWX8 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHERPQ8IWX8 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHERPQ8IWX8 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHERPQ8IWX8 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHERPQ8IWX8 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHERPQ8IWX8 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHERPQ8IWX8 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHERPQ8IWX8 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHERPQ8IWX8 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHERPQ8IWX8 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHERPQ8IWX8 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHERPQ8IWX8 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHERPQ8IWX8 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHERPQ8IWX8 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHERPQ8IWX8 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHERPQ8IWX8 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHERPQ8IWX8 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHERPQ8IWX8 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHERPQ8IWX8 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CHERPQ8IWX8 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms