Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZTR5

CFAP47, Cilia- and flagella-associated protein 47, humanhuman

Predictions only

Length 3,102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP47Q6ZTR5 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CFAP47Q6ZTR5 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CFAP47Q6ZTR5 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CFAP47Q6ZTR5 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CFAP47Q6ZTR5 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CFAP47Q6ZTR5 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CFAP47Q6ZTR5 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CFAP47Q6ZTR5 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CFAP47Q6ZTR5 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CFAP47Q6ZTR5 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CFAP47Q6ZTR5 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CFAP47Q6ZTR5 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CFAP47Q6ZTR5 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CFAP47Q6ZTR5 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CFAP47Q6ZTR5 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CFAP47Q6ZTR5 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.51
CFAP47Q6ZTR5 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CFAP47Q6ZTR5 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CFAP47Q6ZTR5 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CFAP47Q6ZTR5 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CFAP47Q6ZTR5 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CFAP47Q6ZTR5 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CFAP47Q6ZTR5 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CFAP47Q6ZTR5 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CFAP47Q6ZTR5 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CFAP47Q6ZTR5 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CFAP47Q6ZTR5 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CFAP47Q6ZTR5 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CFAP47Q6ZTR5 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CFAP47Q6ZTR5 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CFAP47Q6ZTR5 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CFAP47Q6ZTR5 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CFAP47Q6ZTR5 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CFAP47Q6ZTR5 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CFAP47Q6ZTR5 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CFAP47Q6ZTR5 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CFAP47Q6ZTR5 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CFAP47Q6ZTR5 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CFAP47Q6ZTR5 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CFAP47Q6ZTR5 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CFAP47Q6ZTR5 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CFAP47Q6ZTR5 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CFAP47Q6ZTR5 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CFAP47Q6ZTR5 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CFAP47Q6ZTR5 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CFAP47Q6ZTR5 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CFAP47Q6ZTR5 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CFAP47Q6ZTR5 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CFAP47Q6ZTR5 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CFAP47Q6ZTR5 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CFAP47Q6ZTR5 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CFAP47Q6ZTR5 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CFAP47Q6ZTR5 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CFAP47Q6ZTR5 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CFAP47Q6ZTR5 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CFAP47Q6ZTR5 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CFAP47Q6ZTR5 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CFAP47Q6ZTR5 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CFAP47Q6ZTR5 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CFAP47Q6ZTR5 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CFAP47Q6ZTR5 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CFAP47Q6ZTR5 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CFAP47Q6ZTR5 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CFAP47Q6ZTR5 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CFAP47Q6ZTR5 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CFAP47Q6ZTR5 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CFAP47Q6ZTR5 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CFAP47Q6ZTR5 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CFAP47Q6ZTR5 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CFAP47Q6ZTR5 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CFAP47Q6ZTR5 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CFAP47Q6ZTR5 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CFAP47Q6ZTR5 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CFAP47Q6ZTR5 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CFAP47Q6ZTR5 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CFAP47Q6ZTR5 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CFAP47Q6ZTR5 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CFAP47Q6ZTR5 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CFAP47Q6ZTR5 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CFAP47Q6ZTR5 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.48
CFAP47Q6ZTR5 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.48
CFAP47Q6ZTR5 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CFAP47Q6ZTR5 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CFAP47Q6ZTR5 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CFAP47Q6ZTR5 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CFAP47Q6ZTR5 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CFAP47Q6ZTR5 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CFAP47Q6ZTR5 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CFAP47Q6ZTR5 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CFAP47Q6ZTR5 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CFAP47Q6ZTR5 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CFAP47Q6ZTR5 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CFAP47Q6ZTR5 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CFAP47Q6ZTR5 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CFAP47Q6ZTR5 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CFAP47Q6ZTR5 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CFAP47Q6ZTR5 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CFAP47Q6ZTR5 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CFAP47Q6ZTR5 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CFAP47Q6ZTR5 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms