Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2M8

PNCK, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type 1B, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNCKQ6P2M8 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PNCKQ6P2M8 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PNCKQ6P2M8 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PNCKQ6P2M8 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PNCKQ6P2M8 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
PNCKQ6P2M8 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PNCKQ6P2M8 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PNCKQ6P2M8 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PNCKQ6P2M8 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PNCKQ6P2M8 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PNCKQ6P2M8 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PNCKQ6P2M8 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PNCKQ6P2M8 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PNCKQ6P2M8 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PNCKQ6P2M8 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
PNCKQ6P2M8 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
PNCKQ6P2M8 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PNCKQ6P2M8 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PNCKQ6P2M8 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PNCKQ6P2M8 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PNCKQ6P2M8 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PNCKQ6P2M8 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PNCKQ6P2M8 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PNCKQ6P2M8 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PNCKQ6P2M8 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PNCKQ6P2M8 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PNCKQ6P2M8 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PNCKQ6P2M8 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PNCKQ6P2M8 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
PNCKQ6P2M8 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PNCKQ6P2M8 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PNCKQ6P2M8 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PNCKQ6P2M8 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PNCKQ6P2M8 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PNCKQ6P2M8 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PNCKQ6P2M8 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PNCKQ6P2M8 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PNCKQ6P2M8 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PNCKQ6P2M8 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
PNCKQ6P2M8 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PNCKQ6P2M8 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PNCKQ6P2M8 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PNCKQ6P2M8 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PNCKQ6P2M8 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PNCKQ6P2M8 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PNCKQ6P2M8 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PNCKQ6P2M8 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PNCKQ6P2M8 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PNCKQ6P2M8 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PNCKQ6P2M8 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PNCKQ6P2M8 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PNCKQ6P2M8 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PNCKQ6P2M8 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PNCKQ6P2M8 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PNCKQ6P2M8 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PNCKQ6P2M8 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PNCKQ6P2M8 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PNCKQ6P2M8 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PNCKQ6P2M8 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PNCKQ6P2M8 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PNCKQ6P2M8 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PNCKQ6P2M8 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PNCKQ6P2M8 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
PNCKQ6P2M8 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
PNCKQ6P2M8 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PNCKQ6P2M8 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PNCKQ6P2M8 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PNCKQ6P2M8 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PNCKQ6P2M8 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PNCKQ6P2M8 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PNCKQ6P2M8 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PNCKQ6P2M8 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PNCKQ6P2M8 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PNCKQ6P2M8 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PNCKQ6P2M8 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PNCKQ6P2M8 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PNCKQ6P2M8 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PNCKQ6P2M8 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PNCKQ6P2M8 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PNCKQ6P2M8 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PNCKQ6P2M8 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PNCKQ6P2M8 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PNCKQ6P2M8 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
PNCKQ6P2M8 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PNCKQ6P2M8 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PNCKQ6P2M8 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PNCKQ6P2M8 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PNCKQ6P2M8 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PNCKQ6P2M8 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PNCKQ6P2M8 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PNCKQ6P2M8 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PNCKQ6P2M8 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
PNCKQ6P2M8 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PNCKQ6P2M8 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PNCKQ6P2M8 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
PNCKQ6P2M8 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PNCKQ6P2M8 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PNCKQ6P2M8 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PNCKQ6P2M8 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PNCKQ6P2M8 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.1 ms