Protein–RNA interactions for Protein: Q6JVE6

LCN10, Epididymal-specific lipocalin-10, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCN10Q6JVE6 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LCN10Q6JVE6 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LCN10Q6JVE6 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LCN10Q6JVE6 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LCN10Q6JVE6 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LCN10Q6JVE6 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LCN10Q6JVE6 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LCN10Q6JVE6 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LCN10Q6JVE6 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LCN10Q6JVE6 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LCN10Q6JVE6 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LCN10Q6JVE6 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LCN10Q6JVE6 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LCN10Q6JVE6 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LCN10Q6JVE6 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LCN10Q6JVE6 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LCN10Q6JVE6 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
LCN10Q6JVE6 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LCN10Q6JVE6 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LCN10Q6JVE6 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LCN10Q6JVE6 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LCN10Q6JVE6 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LCN10Q6JVE6 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LCN10Q6JVE6 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LCN10Q6JVE6 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LCN10Q6JVE6 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LCN10Q6JVE6 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LCN10Q6JVE6 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LCN10Q6JVE6 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LCN10Q6JVE6 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LCN10Q6JVE6 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LCN10Q6JVE6 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LCN10Q6JVE6 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LCN10Q6JVE6 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LCN10Q6JVE6 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LCN10Q6JVE6 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LCN10Q6JVE6 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LCN10Q6JVE6 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LCN10Q6JVE6 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
LCN10Q6JVE6 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LCN10Q6JVE6 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LCN10Q6JVE6 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LCN10Q6JVE6 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LCN10Q6JVE6 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LCN10Q6JVE6 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
LCN10Q6JVE6 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LCN10Q6JVE6 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LCN10Q6JVE6 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LCN10Q6JVE6 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LCN10Q6JVE6 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LCN10Q6JVE6 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LCN10Q6JVE6 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LCN10Q6JVE6 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LCN10Q6JVE6 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LCN10Q6JVE6 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LCN10Q6JVE6 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LCN10Q6JVE6 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LCN10Q6JVE6 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LCN10Q6JVE6 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LCN10Q6JVE6 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LCN10Q6JVE6 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LCN10Q6JVE6 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LCN10Q6JVE6 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LCN10Q6JVE6 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LCN10Q6JVE6 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LCN10Q6JVE6 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LCN10Q6JVE6 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LCN10Q6JVE6 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
LCN10Q6JVE6 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LCN10Q6JVE6 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
LCN10Q6JVE6 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LCN10Q6JVE6 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LCN10Q6JVE6 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LCN10Q6JVE6 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LCN10Q6JVE6 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LCN10Q6JVE6 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LCN10Q6JVE6 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LCN10Q6JVE6 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
LCN10Q6JVE6 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LCN10Q6JVE6 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LCN10Q6JVE6 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LCN10Q6JVE6 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LCN10Q6JVE6 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LCN10Q6JVE6 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LCN10Q6JVE6 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LCN10Q6JVE6 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LCN10Q6JVE6 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LCN10Q6JVE6 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LCN10Q6JVE6 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LCN10Q6JVE6 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LCN10Q6JVE6 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LCN10Q6JVE6 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LCN10Q6JVE6 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LCN10Q6JVE6 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LCN10Q6JVE6 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LCN10Q6JVE6 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LCN10Q6JVE6 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LCN10Q6JVE6 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LCN10Q6JVE6 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
LCN10Q6JVE6 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
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