Protein–RNA interactions for Protein: Q5T6F2

UBAP2, Ubiquitin-associated protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBAP2Q5T6F2 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
UBAP2Q5T6F2 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
UBAP2Q5T6F2 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
UBAP2Q5T6F2 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
UBAP2Q5T6F2 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
UBAP2Q5T6F2 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
UBAP2Q5T6F2 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
UBAP2Q5T6F2 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
UBAP2Q5T6F2 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
UBAP2Q5T6F2 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
UBAP2Q5T6F2 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
UBAP2Q5T6F2 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
UBAP2Q5T6F2 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
UBAP2Q5T6F2 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
UBAP2Q5T6F2 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
UBAP2Q5T6F2 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
UBAP2Q5T6F2 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
UBAP2Q5T6F2 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
UBAP2Q5T6F2 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
UBAP2Q5T6F2 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
UBAP2Q5T6F2 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
UBAP2Q5T6F2 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
UBAP2Q5T6F2 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
UBAP2Q5T6F2 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
UBAP2Q5T6F2 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
UBAP2Q5T6F2 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
UBAP2Q5T6F2 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
UBAP2Q5T6F2 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
UBAP2Q5T6F2 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
UBAP2Q5T6F2 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
UBAP2Q5T6F2 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
UBAP2Q5T6F2 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
UBAP2Q5T6F2 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
UBAP2Q5T6F2 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
UBAP2Q5T6F2 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
UBAP2Q5T6F2 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.76
UBAP2Q5T6F2 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
UBAP2Q5T6F2 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
UBAP2Q5T6F2 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
UBAP2Q5T6F2 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
UBAP2Q5T6F2 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
UBAP2Q5T6F2 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
UBAP2Q5T6F2 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
UBAP2Q5T6F2 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
UBAP2Q5T6F2 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
UBAP2Q5T6F2 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
UBAP2Q5T6F2 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
UBAP2Q5T6F2 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC26.04■■□□□ 1.76
UBAP2Q5T6F2 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
UBAP2Q5T6F2 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
UBAP2Q5T6F2 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
UBAP2Q5T6F2 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
UBAP2Q5T6F2 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
UBAP2Q5T6F2 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
UBAP2Q5T6F2 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
UBAP2Q5T6F2 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
UBAP2Q5T6F2 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
UBAP2Q5T6F2 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
UBAP2Q5T6F2 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
UBAP2Q5T6F2 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
UBAP2Q5T6F2 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
UBAP2Q5T6F2 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
UBAP2Q5T6F2 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
UBAP2Q5T6F2 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
UBAP2Q5T6F2 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
UBAP2Q5T6F2 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
UBAP2Q5T6F2 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
UBAP2Q5T6F2 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
UBAP2Q5T6F2 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC26■■□□□ 1.75
UBAP2Q5T6F2 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
UBAP2Q5T6F2 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
UBAP2Q5T6F2 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
UBAP2Q5T6F2 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
UBAP2Q5T6F2 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
UBAP2Q5T6F2 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
UBAP2Q5T6F2 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
UBAP2Q5T6F2 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
UBAP2Q5T6F2 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
UBAP2Q5T6F2 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
UBAP2Q5T6F2 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
UBAP2Q5T6F2 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
UBAP2Q5T6F2 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
UBAP2Q5T6F2 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
UBAP2Q5T6F2 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
UBAP2Q5T6F2 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
UBAP2Q5T6F2 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
UBAP2Q5T6F2 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
UBAP2Q5T6F2 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
UBAP2Q5T6F2 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
UBAP2Q5T6F2 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
UBAP2Q5T6F2 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
UBAP2Q5T6F2 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
UBAP2Q5T6F2 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
UBAP2Q5T6F2 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
UBAP2Q5T6F2 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
UBAP2Q5T6F2 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
UBAP2Q5T6F2 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
UBAP2Q5T6F2 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
UBAP2Q5T6F2 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
UBAP2Q5T6F2 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.2 ms