Protein–RNA interactions for Protein: Q1HG43

DUOXA1, Dual oxidase maturation factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUOXA1Q1HG43 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
DUOXA1Q1HG43 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
DUOXA1Q1HG43 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
DUOXA1Q1HG43 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
DUOXA1Q1HG43 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
DUOXA1Q1HG43 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
DUOXA1Q1HG43 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
DUOXA1Q1HG43 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
DUOXA1Q1HG43 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
DUOXA1Q1HG43 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
DUOXA1Q1HG43 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
DUOXA1Q1HG43 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
DUOXA1Q1HG43 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
DUOXA1Q1HG43 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
DUOXA1Q1HG43 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
DUOXA1Q1HG43 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
DUOXA1Q1HG43 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
DUOXA1Q1HG43 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
DUOXA1Q1HG43 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
DUOXA1Q1HG43 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
DUOXA1Q1HG43 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
DUOXA1Q1HG43 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
DUOXA1Q1HG43 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
DUOXA1Q1HG43 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
DUOXA1Q1HG43 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
DUOXA1Q1HG43 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
DUOXA1Q1HG43 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
DUOXA1Q1HG43 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
DUOXA1Q1HG43 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
DUOXA1Q1HG43 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
DUOXA1Q1HG43 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
DUOXA1Q1HG43 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
DUOXA1Q1HG43 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
DUOXA1Q1HG43 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
DUOXA1Q1HG43 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
DUOXA1Q1HG43 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
DUOXA1Q1HG43 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
DUOXA1Q1HG43 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
DUOXA1Q1HG43 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
DUOXA1Q1HG43 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
DUOXA1Q1HG43 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
DUOXA1Q1HG43 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
DUOXA1Q1HG43 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
DUOXA1Q1HG43 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
DUOXA1Q1HG43 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
DUOXA1Q1HG43 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
DUOXA1Q1HG43 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
DUOXA1Q1HG43 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
DUOXA1Q1HG43 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
DUOXA1Q1HG43 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
DUOXA1Q1HG43 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
DUOXA1Q1HG43 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
DUOXA1Q1HG43 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
DUOXA1Q1HG43 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
DUOXA1Q1HG43 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
DUOXA1Q1HG43 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
DUOXA1Q1HG43 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
DUOXA1Q1HG43 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
DUOXA1Q1HG43 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
DUOXA1Q1HG43 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
DUOXA1Q1HG43 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
DUOXA1Q1HG43 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
DUOXA1Q1HG43 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
DUOXA1Q1HG43 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
DUOXA1Q1HG43 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
DUOXA1Q1HG43 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
DUOXA1Q1HG43 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
DUOXA1Q1HG43 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
DUOXA1Q1HG43 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
DUOXA1Q1HG43 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
DUOXA1Q1HG43 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
DUOXA1Q1HG43 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
DUOXA1Q1HG43 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
DUOXA1Q1HG43 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
DUOXA1Q1HG43 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
DUOXA1Q1HG43 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
DUOXA1Q1HG43 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
DUOXA1Q1HG43 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
DUOXA1Q1HG43 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
DUOXA1Q1HG43 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
DUOXA1Q1HG43 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
DUOXA1Q1HG43 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
DUOXA1Q1HG43 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
DUOXA1Q1HG43 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
DUOXA1Q1HG43 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
DUOXA1Q1HG43 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
DUOXA1Q1HG43 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
DUOXA1Q1HG43 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
DUOXA1Q1HG43 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
DUOXA1Q1HG43 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
DUOXA1Q1HG43 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
DUOXA1Q1HG43 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
DUOXA1Q1HG43 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
DUOXA1Q1HG43 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
DUOXA1Q1HG43 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
DUOXA1Q1HG43 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
DUOXA1Q1HG43 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
DUOXA1Q1HG43 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
DUOXA1Q1HG43 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
DUOXA1Q1HG43 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms