Protein–RNA interactions for Protein: Q15911

ZFHX3, Zinc finger homeobox protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 3,703 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFHX3Q15911 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZFHX3Q15911 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZFHX3Q15911 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZFHX3Q15911 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZFHX3Q15911 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZFHX3Q15911 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZFHX3Q15911 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZFHX3Q15911 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZFHX3Q15911 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZFHX3Q15911 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ZFHX3Q15911 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ZFHX3Q15911 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZFHX3Q15911 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZFHX3Q15911 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZFHX3Q15911 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZFHX3Q15911 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZFHX3Q15911 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZFHX3Q15911 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZFHX3Q15911 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZFHX3Q15911 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZFHX3Q15911 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZFHX3Q15911 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZFHX3Q15911 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZFHX3Q15911 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZFHX3Q15911 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZFHX3Q15911 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZFHX3Q15911 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZFHX3Q15911 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZFHX3Q15911 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZFHX3Q15911 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZFHX3Q15911 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZFHX3Q15911 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
ZFHX3Q15911 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZFHX3Q15911 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZFHX3Q15911 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZFHX3Q15911 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZFHX3Q15911 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZFHX3Q15911 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZFHX3Q15911 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZFHX3Q15911 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZFHX3Q15911 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZFHX3Q15911 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
ZFHX3Q15911 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZFHX3Q15911 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZFHX3Q15911 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZFHX3Q15911 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZFHX3Q15911 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZFHX3Q15911 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZFHX3Q15911 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
ZFHX3Q15911 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZFHX3Q15911 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZFHX3Q15911 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZFHX3Q15911 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZFHX3Q15911 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZFHX3Q15911 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
ZFHX3Q15911 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
ZFHX3Q15911 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZFHX3Q15911 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
ZFHX3Q15911 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZFHX3Q15911 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZFHX3Q15911 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZFHX3Q15911 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZFHX3Q15911 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZFHX3Q15911 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZFHX3Q15911 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
ZFHX3Q15911 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZFHX3Q15911 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZFHX3Q15911 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZFHX3Q15911 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZFHX3Q15911 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZFHX3Q15911 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZFHX3Q15911 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZFHX3Q15911 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZFHX3Q15911 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZFHX3Q15911 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZFHX3Q15911 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZFHX3Q15911 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZFHX3Q15911 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZFHX3Q15911 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ZFHX3Q15911 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ZFHX3Q15911 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
ZFHX3Q15911 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZFHX3Q15911 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZFHX3Q15911 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZFHX3Q15911 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZFHX3Q15911 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZFHX3Q15911 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZFHX3Q15911 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZFHX3Q15911 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZFHX3Q15911 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZFHX3Q15911 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZFHX3Q15911 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZFHX3Q15911 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZFHX3Q15911 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZFHX3Q15911 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZFHX3Q15911 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZFHX3Q15911 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZFHX3Q15911 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZFHX3Q15911 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZFHX3Q15911 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
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