Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

Predictions only

Length 1,683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
SHPRHQ149N8 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC36.06■■■■□ 3.36
SHPRHQ149N8 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC36.06■■■■□ 3.36
SHPRHQ149N8 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC36.05■■■■□ 3.36
SHPRHQ149N8 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.05■■■■□ 3.36
SHPRHQ149N8 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
SHPRHQ149N8 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC36.03■■■■□ 3.36
SHPRHQ149N8 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.01■■■■□ 3.35
SHPRHQ149N8 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
SHPRHQ149N8 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
SHPRHQ149N8 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC36■■■■□ 3.35
SHPRHQ149N8 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
SHPRHQ149N8 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
SHPRHQ149N8 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.99■■■■□ 3.35
SHPRHQ149N8 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC35.98■■■■□ 3.35
SHPRHQ149N8 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
SHPRHQ149N8 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC35.97■■■■□ 3.35
SHPRHQ149N8 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC35.96■■■■□ 3.35
SHPRHQ149N8 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC35.96■■■■□ 3.35
SHPRHQ149N8 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC35.96■■■■□ 3.35
SHPRHQ149N8 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC35.95■■■■□ 3.35
SHPRHQ149N8 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC35.95■■■■□ 3.35
SHPRHQ149N8 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
SHPRHQ149N8 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
SHPRHQ149N8 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC35.94■■■■□ 3.34
SHPRHQ149N8 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC35.94■■■■□ 3.34
SHPRHQ149N8 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC35.94■■■■□ 3.34
SHPRHQ149N8 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC35.93■■■■□ 3.34
SHPRHQ149N8 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.93■■■■□ 3.34
SHPRHQ149N8 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
SHPRHQ149N8 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
SHPRHQ149N8 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC35.92■■■■□ 3.34
SHPRHQ149N8 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
SHPRHQ149N8 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.92■■■■□ 3.34
SHPRHQ149N8 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
SHPRHQ149N8 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
SHPRHQ149N8 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC35.91■■■■□ 3.34
SHPRHQ149N8 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
SHPRHQ149N8 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC35.91■■■■□ 3.34
SHPRHQ149N8 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
SHPRHQ149N8 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC35.91■■■■□ 3.34
SHPRHQ149N8 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC35.9■■■■□ 3.34
SHPRHQ149N8 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
SHPRHQ149N8 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC35.89■■■■□ 3.34
SHPRHQ149N8 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC35.89■■■■□ 3.34
SHPRHQ149N8 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC35.88■■■■□ 3.33
SHPRHQ149N8 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
SHPRHQ149N8 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC35.87■■■■□ 3.33
SHPRHQ149N8 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.87■■■■□ 3.33
SHPRHQ149N8 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
SHPRHQ149N8 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
SHPRHQ149N8 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC35.84■■■■□ 3.33
SHPRHQ149N8 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.84■■■■□ 3.33
SHPRHQ149N8 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
SHPRHQ149N8 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.33
SHPRHQ149N8 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.82■■■■□ 3.33
SHPRHQ149N8 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC35.82■■■■□ 3.33
SHPRHQ149N8 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC35.82■■■■□ 3.33
SHPRHQ149N8 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC35.81■■■■□ 3.32
SHPRHQ149N8 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC35.81■■■■□ 3.32
SHPRHQ149N8 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC35.81■■■■□ 3.32
SHPRHQ149N8 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
SHPRHQ149N8 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.81■■■■□ 3.32
SHPRHQ149N8 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC35.81■■■■□ 3.32
SHPRHQ149N8 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
SHPRHQ149N8 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC35.81■■■■□ 3.32
SHPRHQ149N8 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
SHPRHQ149N8 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
SHPRHQ149N8 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC35.8■■■■□ 3.32
SHPRHQ149N8 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC35.8■■■■□ 3.32
SHPRHQ149N8 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
SHPRHQ149N8 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
SHPRHQ149N8 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
SHPRHQ149N8 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
SHPRHQ149N8 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
SHPRHQ149N8 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC35.78■■■■□ 3.32
SHPRHQ149N8 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
SHPRHQ149N8 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
SHPRHQ149N8 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC35.77■■■■□ 3.32
SHPRHQ149N8 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
SHPRHQ149N8 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC35.76■■■■□ 3.31
SHPRHQ149N8 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC35.75■■■■□ 3.31
SHPRHQ149N8 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
SHPRHQ149N8 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
SHPRHQ149N8 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC35.74■■■■□ 3.31
SHPRHQ149N8 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC35.74■■■■□ 3.31
SHPRHQ149N8 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC35.74■■■■□ 3.31
SHPRHQ149N8 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
SHPRHQ149N8 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
SHPRHQ149N8 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.73■■■■□ 3.31
SHPRHQ149N8 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC35.73■■■■□ 3.31
SHPRHQ149N8 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
SHPRHQ149N8 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
SHPRHQ149N8 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
SHPRHQ149N8 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC35.72■■■■□ 3.31
SHPRHQ149N8 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
SHPRHQ149N8 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
SHPRHQ149N8 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
SHPRHQ149N8 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC35.69■■■■□ 3.3
SHPRHQ149N8 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC35.68■■■■□ 3.3
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