Protein–RNA interactions for Protein: Q14139

UBE4A, Ubiquitin conjugation factor E4 A, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE4AQ14139 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
UBE4AQ14139 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
UBE4AQ14139 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
UBE4AQ14139 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
UBE4AQ14139 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
UBE4AQ14139 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC31.6■■■□□ 2.65
UBE4AQ14139 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC31.6■■■□□ 2.65
UBE4AQ14139 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
UBE4AQ14139 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.6■■■□□ 2.65
UBE4AQ14139 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC31.59■■■□□ 2.65
UBE4AQ14139 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
UBE4AQ14139 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
UBE4AQ14139 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
UBE4AQ14139 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
UBE4AQ14139 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
UBE4AQ14139 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.56■■■□□ 2.64
UBE4AQ14139 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC31.56■■■□□ 2.64
UBE4AQ14139 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC31.56■■■□□ 2.64
UBE4AQ14139 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC31.56■■■□□ 2.64
UBE4AQ14139 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
UBE4AQ14139 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
UBE4AQ14139 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.55■■■□□ 2.64
UBE4AQ14139 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC31.55■■■□□ 2.64
UBE4AQ14139 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
UBE4AQ14139 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
UBE4AQ14139 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
UBE4AQ14139 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
UBE4AQ14139 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC31.53■■■□□ 2.64
UBE4AQ14139 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
UBE4AQ14139 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
UBE4AQ14139 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
UBE4AQ14139 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC31.51■■■□□ 2.63
UBE4AQ14139 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
UBE4AQ14139 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC31.5■■■□□ 2.63
UBE4AQ14139 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
UBE4AQ14139 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
UBE4AQ14139 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC31.5■■■□□ 2.63
UBE4AQ14139 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
UBE4AQ14139 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
UBE4AQ14139 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.48■■■□□ 2.63
UBE4AQ14139 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
UBE4AQ14139 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
UBE4AQ14139 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.48■■■□□ 2.63
UBE4AQ14139 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC31.47■■■□□ 2.63
UBE4AQ14139 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
UBE4AQ14139 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
UBE4AQ14139 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
UBE4AQ14139 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
UBE4AQ14139 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
UBE4AQ14139 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.46■■■□□ 2.63
UBE4AQ14139 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
UBE4AQ14139 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC31.46■■■□□ 2.63
UBE4AQ14139 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
UBE4AQ14139 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
UBE4AQ14139 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
UBE4AQ14139 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.45■■■□□ 2.63
UBE4AQ14139 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
UBE4AQ14139 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.44■■■□□ 2.62
UBE4AQ14139 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
UBE4AQ14139 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC31.43■■■□□ 2.62
UBE4AQ14139 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.43■■■□□ 2.62
UBE4AQ14139 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
UBE4AQ14139 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
UBE4AQ14139 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
UBE4AQ14139 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC31.41■■■□□ 2.62
UBE4AQ14139 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC31.41■■■□□ 2.62
UBE4AQ14139 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC31.41■■■□□ 2.62
UBE4AQ14139 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
UBE4AQ14139 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
UBE4AQ14139 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC31.4■■■□□ 2.62
UBE4AQ14139 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
UBE4AQ14139 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
UBE4AQ14139 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
UBE4AQ14139 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
UBE4AQ14139 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC31.39■■■□□ 2.62
UBE4AQ14139 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC31.39■■■□□ 2.62
UBE4AQ14139 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
UBE4AQ14139 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
UBE4AQ14139 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC31.38■■■□□ 2.61
UBE4AQ14139 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC31.38■■■□□ 2.61
UBE4AQ14139 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
UBE4AQ14139 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC31.38■■■□□ 2.61
UBE4AQ14139 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
UBE4AQ14139 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
UBE4AQ14139 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
UBE4AQ14139 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
UBE4AQ14139 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
UBE4AQ14139 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC31.36■■■□□ 2.61
UBE4AQ14139 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC31.36■■■□□ 2.61
UBE4AQ14139 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
UBE4AQ14139 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.35■■■□□ 2.61
UBE4AQ14139 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
UBE4AQ14139 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
UBE4AQ14139 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC31.35■■■□□ 2.61
UBE4AQ14139 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC31.35■■■□□ 2.61
UBE4AQ14139 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
UBE4AQ14139 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.35■■■□□ 2.61
UBE4AQ14139 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
UBE4AQ14139 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
UBE4AQ14139 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.33■■■□□ 2.61
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