Protein–RNA interactions for Protein: P62316

SNRPD2, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPD2P62316 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNRPD2P62316 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNRPD2P62316 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNRPD2P62316 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNRPD2P62316 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNRPD2P62316 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNRPD2P62316 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNRPD2P62316 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNRPD2P62316 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNRPD2P62316 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNRPD2P62316 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNRPD2P62316 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNRPD2P62316 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SNRPD2P62316 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNRPD2P62316 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNRPD2P62316 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNRPD2P62316 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNRPD2P62316 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNRPD2P62316 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNRPD2P62316 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SNRPD2P62316 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SNRPD2P62316 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SNRPD2P62316 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNRPD2P62316 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SNRPD2P62316 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNRPD2P62316 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNRPD2P62316 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNRPD2P62316 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SNRPD2P62316 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNRPD2P62316 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNRPD2P62316 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNRPD2P62316 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SNRPD2P62316 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SNRPD2P62316 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SNRPD2P62316 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SNRPD2P62316 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNRPD2P62316 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNRPD2P62316 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNRPD2P62316 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNRPD2P62316 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNRPD2P62316 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNRPD2P62316 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNRPD2P62316 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNRPD2P62316 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNRPD2P62316 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNRPD2P62316 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNRPD2P62316 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SNRPD2P62316 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SNRPD2P62316 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SNRPD2P62316 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNRPD2P62316 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNRPD2P62316 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNRPD2P62316 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNRPD2P62316 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNRPD2P62316 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNRPD2P62316 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNRPD2P62316 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNRPD2P62316 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNRPD2P62316 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNRPD2P62316 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNRPD2P62316 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNRPD2P62316 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNRPD2P62316 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNRPD2P62316 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNRPD2P62316 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNRPD2P62316 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNRPD2P62316 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNRPD2P62316 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNRPD2P62316 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNRPD2P62316 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNRPD2P62316 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNRPD2P62316 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNRPD2P62316 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNRPD2P62316 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNRPD2P62316 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNRPD2P62316 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNRPD2P62316 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNRPD2P62316 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SNRPD2P62316 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNRPD2P62316 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNRPD2P62316 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNRPD2P62316 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNRPD2P62316 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNRPD2P62316 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNRPD2P62316 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNRPD2P62316 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNRPD2P62316 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNRPD2P62316 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNRPD2P62316 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNRPD2P62316 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNRPD2P62316 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNRPD2P62316 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNRPD2P62316 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNRPD2P62316 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNRPD2P62316 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNRPD2P62316 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNRPD2P62316 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNRPD2P62316 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNRPD2P62316 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNRPD2P62316 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms