Protein–RNA interactions for Protein: P14222

PRF1, Perforin-1, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRF1P14222 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRF1P14222 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRF1P14222 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRF1P14222 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRF1P14222 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRF1P14222 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRF1P14222 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRF1P14222 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRF1P14222 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRF1P14222 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
PRF1P14222 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRF1P14222 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRF1P14222 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PRF1P14222 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRF1P14222 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRF1P14222 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRF1P14222 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRF1P14222 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRF1P14222 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRF1P14222 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRF1P14222 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRF1P14222 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRF1P14222 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRF1P14222 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRF1P14222 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRF1P14222 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRF1P14222 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRF1P14222 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRF1P14222 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRF1P14222 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRF1P14222 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRF1P14222 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRF1P14222 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PRF1P14222 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PRF1P14222 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
PRF1P14222 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PRF1P14222 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PRF1P14222 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PRF1P14222 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PRF1P14222 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRF1P14222 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRF1P14222 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRF1P14222 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRF1P14222 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRF1P14222 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRF1P14222 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRF1P14222 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRF1P14222 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRF1P14222 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRF1P14222 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRF1P14222 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PRF1P14222 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRF1P14222 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRF1P14222 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRF1P14222 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRF1P14222 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRF1P14222 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRF1P14222 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRF1P14222 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRF1P14222 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PRF1P14222 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRF1P14222 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PRF1P14222 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRF1P14222 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRF1P14222 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRF1P14222 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRF1P14222 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRF1P14222 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PRF1P14222 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRF1P14222 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRF1P14222 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRF1P14222 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRF1P14222 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRF1P14222 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRF1P14222 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRF1P14222 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRF1P14222 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRF1P14222 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRF1P14222 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRF1P14222 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRF1P14222 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRF1P14222 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRF1P14222 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRF1P14222 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRF1P14222 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRF1P14222 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRF1P14222 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRF1P14222 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRF1P14222 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRF1P14222 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRF1P14222 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRF1P14222 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRF1P14222 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRF1P14222 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRF1P14222 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRF1P14222 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRF1P14222 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PRF1P14222 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRF1P14222 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRF1P14222 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.3 ms