Protein–RNA interactions for Protein: P10600

TGFB3, Transforming growth factor beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGFB3P10600 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
TGFB3P10600 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
TGFB3P10600 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TGFB3P10600 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TGFB3P10600 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TGFB3P10600 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
TGFB3P10600 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
TGFB3P10600 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
TGFB3P10600 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
TGFB3P10600 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
TGFB3P10600 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
TGFB3P10600 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
TGFB3P10600 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
TGFB3P10600 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
TGFB3P10600 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
TGFB3P10600 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
TGFB3P10600 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
TGFB3P10600 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC29.01■■■□□ 2.23
TGFB3P10600 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC29■■■□□ 2.23
TGFB3P10600 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
TGFB3P10600 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
TGFB3P10600 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
TGFB3P10600 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
TGFB3P10600 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
TGFB3P10600 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
TGFB3P10600 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
TGFB3P10600 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
TGFB3P10600 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
TGFB3P10600 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
TGFB3P10600 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
TGFB3P10600 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
TGFB3P10600 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
TGFB3P10600 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
TGFB3P10600 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
TGFB3P10600 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TGFB3P10600 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
TGFB3P10600 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
TGFB3P10600 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TGFB3P10600 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
TGFB3P10600 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
TGFB3P10600 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
TGFB3P10600 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
TGFB3P10600 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TGFB3P10600 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
TGFB3P10600 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
TGFB3P10600 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
TGFB3P10600 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
TGFB3P10600 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
TGFB3P10600 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.91■■■□□ 2.22
TGFB3P10600 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
TGFB3P10600 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
TGFB3P10600 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
TGFB3P10600 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
TGFB3P10600 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
TGFB3P10600 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
TGFB3P10600 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
TGFB3P10600 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
TGFB3P10600 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
TGFB3P10600 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
TGFB3P10600 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
TGFB3P10600 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
TGFB3P10600 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
TGFB3P10600 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
TGFB3P10600 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
TGFB3P10600 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
TGFB3P10600 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
TGFB3P10600 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
TGFB3P10600 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
TGFB3P10600 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
TGFB3P10600 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
TGFB3P10600 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
TGFB3P10600 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
TGFB3P10600 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
TGFB3P10600 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
TGFB3P10600 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
TGFB3P10600 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
TGFB3P10600 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
TGFB3P10600 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
TGFB3P10600 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
TGFB3P10600 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
TGFB3P10600 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
TGFB3P10600 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
TGFB3P10600 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
TGFB3P10600 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
TGFB3P10600 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
TGFB3P10600 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
TGFB3P10600 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
TGFB3P10600 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC28.81■■■□□ 2.2
TGFB3P10600 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
TGFB3P10600 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
TGFB3P10600 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
TGFB3P10600 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
TGFB3P10600 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
TGFB3P10600 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
TGFB3P10600 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
TGFB3P10600 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
TGFB3P10600 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
TGFB3P10600 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
TGFB3P10600 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
TGFB3P10600 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.1 ms