Protein–RNA interactions for Protein: P04632

CAPNS1, Calpain small subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1P04632 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CAPNS1P04632 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CAPNS1P04632 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CAPNS1P04632 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CAPNS1P04632 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CAPNS1P04632 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CAPNS1P04632 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CAPNS1P04632 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CAPNS1P04632 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CAPNS1P04632 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CAPNS1P04632 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CAPNS1P04632 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CAPNS1P04632 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CAPNS1P04632 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CAPNS1P04632 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CAPNS1P04632 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CAPNS1P04632 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
CAPNS1P04632 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CAPNS1P04632 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CAPNS1P04632 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CAPNS1P04632 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CAPNS1P04632 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CAPNS1P04632 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CAPNS1P04632 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CAPNS1P04632 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CAPNS1P04632 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CAPNS1P04632 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CAPNS1P04632 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CAPNS1P04632 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CAPNS1P04632 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CAPNS1P04632 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CAPNS1P04632 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CAPNS1P04632 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CAPNS1P04632 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
CAPNS1P04632 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CAPNS1P04632 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CAPNS1P04632 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CAPNS1P04632 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CAPNS1P04632 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CAPNS1P04632 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CAPNS1P04632 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CAPNS1P04632 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CAPNS1P04632 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CAPNS1P04632 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CAPNS1P04632 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CAPNS1P04632 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CAPNS1P04632 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CAPNS1P04632 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CAPNS1P04632 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CAPNS1P04632 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CAPNS1P04632 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CAPNS1P04632 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CAPNS1P04632 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CAPNS1P04632 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CAPNS1P04632 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CAPNS1P04632 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CAPNS1P04632 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CAPNS1P04632 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CAPNS1P04632 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CAPNS1P04632 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CAPNS1P04632 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CAPNS1P04632 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CAPNS1P04632 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CAPNS1P04632 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CAPNS1P04632 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CAPNS1P04632 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CAPNS1P04632 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CAPNS1P04632 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
CAPNS1P04632 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CAPNS1P04632 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CAPNS1P04632 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CAPNS1P04632 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CAPNS1P04632 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CAPNS1P04632 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CAPNS1P04632 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CAPNS1P04632 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CAPNS1P04632 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CAPNS1P04632 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CAPNS1P04632 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CAPNS1P04632 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CAPNS1P04632 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CAPNS1P04632 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CAPNS1P04632 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CAPNS1P04632 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CAPNS1P04632 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CAPNS1P04632 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CAPNS1P04632 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CAPNS1P04632 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CAPNS1P04632 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CAPNS1P04632 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CAPNS1P04632 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CAPNS1P04632 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CAPNS1P04632 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CAPNS1P04632 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CAPNS1P04632 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CAPNS1P04632 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CAPNS1P04632 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CAPNS1P04632 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CAPNS1P04632 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CAPNS1P04632 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms