Protein–RNA interactions for Protein: P02748

C9, Complement component C9, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9P02748 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
C9P02748 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
C9P02748 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
C9P02748 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
C9P02748 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
C9P02748 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
C9P02748 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
C9P02748 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
C9P02748 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
C9P02748 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
C9P02748 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
C9P02748 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
C9P02748 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
C9P02748 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
C9P02748 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
C9P02748 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
C9P02748 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
C9P02748 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
C9P02748 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
C9P02748 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
C9P02748 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
C9P02748 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
C9P02748 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
C9P02748 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
C9P02748 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
C9P02748 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
C9P02748 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
C9P02748 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
C9P02748 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
C9P02748 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
C9P02748 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
C9P02748 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
C9P02748 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
C9P02748 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
C9P02748 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
C9P02748 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
C9P02748 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
C9P02748 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
C9P02748 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
C9P02748 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
C9P02748 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
C9P02748 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
C9P02748 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
C9P02748 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
C9P02748 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
C9P02748 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
C9P02748 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
C9P02748 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
C9P02748 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
C9P02748 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
C9P02748 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
C9P02748 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
C9P02748 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
C9P02748 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
C9P02748 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
C9P02748 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
C9P02748 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
C9P02748 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
C9P02748 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
C9P02748 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
C9P02748 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
C9P02748 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
C9P02748 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
C9P02748 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
C9P02748 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
C9P02748 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
C9P02748 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
C9P02748 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
C9P02748 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
C9P02748 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
C9P02748 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
C9P02748 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
C9P02748 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
C9P02748 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
C9P02748 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
C9P02748 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
C9P02748 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
C9P02748 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
C9P02748 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
C9P02748 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
C9P02748 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
C9P02748 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
C9P02748 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
C9P02748 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
C9P02748 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
C9P02748 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
C9P02748 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
C9P02748 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
C9P02748 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
C9P02748 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
C9P02748 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
C9P02748 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
C9P02748 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
C9P02748 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
C9P02748 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
C9P02748 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
C9P02748 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
C9P02748 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
C9P02748 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
C9P02748 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.1 ms