Protein–RNA interactions for Protein: O75888

TNFSF13, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 13, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF13O75888 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
TNFSF13O75888 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNFSF13O75888 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNFSF13O75888 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNFSF13O75888 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNFSF13O75888 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNFSF13O75888 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNFSF13O75888 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNFSF13O75888 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNFSF13O75888 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TNFSF13O75888 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNFSF13O75888 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNFSF13O75888 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNFSF13O75888 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNFSF13O75888 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNFSF13O75888 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TNFSF13O75888 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNFSF13O75888 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNFSF13O75888 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNFSF13O75888 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNFSF13O75888 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNFSF13O75888 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNFSF13O75888 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TNFSF13O75888 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNFSF13O75888 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNFSF13O75888 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNFSF13O75888 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNFSF13O75888 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNFSF13O75888 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNFSF13O75888 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNFSF13O75888 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNFSF13O75888 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNFSF13O75888 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNFSF13O75888 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TNFSF13O75888 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TNFSF13O75888 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TNFSF13O75888 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TNFSF13O75888 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TNFSF13O75888 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TNFSF13O75888 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TNFSF13O75888 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TNFSF13O75888 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TNFSF13O75888 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TNFSF13O75888 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNFSF13O75888 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TNFSF13O75888 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNFSF13O75888 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNFSF13O75888 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TNFSF13O75888 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TNFSF13O75888 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TNFSF13O75888 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TNFSF13O75888 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TNFSF13O75888 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TNFSF13O75888 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TNFSF13O75888 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TNFSF13O75888 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
TNFSF13O75888 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TNFSF13O75888 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TNFSF13O75888 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TNFSF13O75888 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TNFSF13O75888 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TNFSF13O75888 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TNFSF13O75888 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TNFSF13O75888 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TNFSF13O75888 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TNFSF13O75888 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TNFSF13O75888 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TNFSF13O75888 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TNFSF13O75888 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TNFSF13O75888 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TNFSF13O75888 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TNFSF13O75888 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TNFSF13O75888 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TNFSF13O75888 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TNFSF13O75888 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
TNFSF13O75888 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TNFSF13O75888 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TNFSF13O75888 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TNFSF13O75888 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TNFSF13O75888 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TNFSF13O75888 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TNFSF13O75888 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TNFSF13O75888 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNFSF13O75888 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNFSF13O75888 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNFSF13O75888 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNFSF13O75888 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNFSF13O75888 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNFSF13O75888 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNFSF13O75888 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TNFSF13O75888 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TNFSF13O75888 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TNFSF13O75888 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TNFSF13O75888 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TNFSF13O75888 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TNFSF13O75888 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TNFSF13O75888 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TNFSF13O75888 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNFSF13O75888 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNFSF13O75888 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms