Protein–RNA interactions for Protein: O60224

SSX4, Protein SSX4, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX4O60224 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SSX4O60224 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SSX4O60224 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SSX4O60224 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SSX4O60224 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SSX4O60224 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SSX4O60224 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SSX4O60224 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SSX4O60224 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SSX4O60224 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SSX4O60224 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SSX4O60224 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SSX4O60224 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
SSX4O60224 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SSX4O60224 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SSX4O60224 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SSX4O60224 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SSX4O60224 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SSX4O60224 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SSX4O60224 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SSX4O60224 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SSX4O60224 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SSX4O60224 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SSX4O60224 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SSX4O60224 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SSX4O60224 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SSX4O60224 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SSX4O60224 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SSX4O60224 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SSX4O60224 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SSX4O60224 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SSX4O60224 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SSX4O60224 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SSX4O60224 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SSX4O60224 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SSX4O60224 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SSX4O60224 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SSX4O60224 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SSX4O60224 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SSX4O60224 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SSX4O60224 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SSX4O60224 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SSX4O60224 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SSX4O60224 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SSX4O60224 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SSX4O60224 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SSX4O60224 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SSX4O60224 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SSX4O60224 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SSX4O60224 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SSX4O60224 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SSX4O60224 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SSX4O60224 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SSX4O60224 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SSX4O60224 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SSX4O60224 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SSX4O60224 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SSX4O60224 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SSX4O60224 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SSX4O60224 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SSX4O60224 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SSX4O60224 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SSX4O60224 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SSX4O60224 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SSX4O60224 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SSX4O60224 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SSX4O60224 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SSX4O60224 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SSX4O60224 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SSX4O60224 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SSX4O60224 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SSX4O60224 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SSX4O60224 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SSX4O60224 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SSX4O60224 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SSX4O60224 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SSX4O60224 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SSX4O60224 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SSX4O60224 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SSX4O60224 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SSX4O60224 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SSX4O60224 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SSX4O60224 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SSX4O60224 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SSX4O60224 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SSX4O60224 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SSX4O60224 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SSX4O60224 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SSX4O60224 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SSX4O60224 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SSX4O60224 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SSX4O60224 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SSX4O60224 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SSX4O60224 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SSX4O60224 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SSX4O60224 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SSX4O60224 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SSX4O60224 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SSX4O60224 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SSX4O60224 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 412.1 ms