Protein–RNA interactions for Protein: O43497

CACNA1G, Voltage-dependent T-type calcium channel subunit alpha-1G, humanhuman

Predictions only

Length 2,377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1GO43497 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CACNA1GO43497 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CACNA1GO43497 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CACNA1GO43497 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CACNA1GO43497 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CACNA1GO43497 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CACNA1GO43497 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CACNA1GO43497 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CACNA1GO43497 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CACNA1GO43497 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CACNA1GO43497 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CACNA1GO43497 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CACNA1GO43497 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CACNA1GO43497 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CACNA1GO43497 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CACNA1GO43497 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CACNA1GO43497 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CACNA1GO43497 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CACNA1GO43497 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CACNA1GO43497 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CACNA1GO43497 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CACNA1GO43497 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CACNA1GO43497 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CACNA1GO43497 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CACNA1GO43497 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CACNA1GO43497 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CACNA1GO43497 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CACNA1GO43497 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CACNA1GO43497 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CACNA1GO43497 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CACNA1GO43497 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CACNA1GO43497 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CACNA1GO43497 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CACNA1GO43497 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CACNA1GO43497 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CACNA1GO43497 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CACNA1GO43497 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CACNA1GO43497 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CACNA1GO43497 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CACNA1GO43497 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CACNA1GO43497 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CACNA1GO43497 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CACNA1GO43497 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CACNA1GO43497 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CACNA1GO43497 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CACNA1GO43497 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CACNA1GO43497 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CACNA1GO43497 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CACNA1GO43497 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CACNA1GO43497 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CACNA1GO43497 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CACNA1GO43497 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CACNA1GO43497 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CACNA1GO43497 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CACNA1GO43497 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CACNA1GO43497 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CACNA1GO43497 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CACNA1GO43497 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CACNA1GO43497 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CACNA1GO43497 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CACNA1GO43497 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CACNA1GO43497 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CACNA1GO43497 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CACNA1GO43497 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CACNA1GO43497 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CACNA1GO43497 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CACNA1GO43497 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CACNA1GO43497 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CACNA1GO43497 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CACNA1GO43497 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CACNA1GO43497 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CACNA1GO43497 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CACNA1GO43497 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CACNA1GO43497 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CACNA1GO43497 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CACNA1GO43497 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CACNA1GO43497 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CACNA1GO43497 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CACNA1GO43497 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CACNA1GO43497 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CACNA1GO43497 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CACNA1GO43497 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CACNA1GO43497 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CACNA1GO43497 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CACNA1GO43497 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CACNA1GO43497 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CACNA1GO43497 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CACNA1GO43497 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CACNA1GO43497 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CACNA1GO43497 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CACNA1GO43497 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CACNA1GO43497 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CACNA1GO43497 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CACNA1GO43497 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CACNA1GO43497 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CACNA1GO43497 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CACNA1GO43497 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CACNA1GO43497 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CACNA1GO43497 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CACNA1GO43497 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms