Protein–RNA interactions for Protein: O15105

SMAD7, Mothers against decapentaplegic homolog 7, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD7O15105 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SMAD7O15105 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SMAD7O15105 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMAD7O15105 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMAD7O15105 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMAD7O15105 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMAD7O15105 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMAD7O15105 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMAD7O15105 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SMAD7O15105 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SMAD7O15105 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SMAD7O15105 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SMAD7O15105 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SMAD7O15105 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMAD7O15105 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SMAD7O15105 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMAD7O15105 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMAD7O15105 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMAD7O15105 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMAD7O15105 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SMAD7O15105 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMAD7O15105 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMAD7O15105 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SMAD7O15105 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMAD7O15105 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMAD7O15105 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMAD7O15105 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMAD7O15105 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMAD7O15105 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMAD7O15105 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMAD7O15105 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMAD7O15105 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMAD7O15105 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMAD7O15105 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMAD7O15105 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMAD7O15105 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SMAD7O15105 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SMAD7O15105 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMAD7O15105 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SMAD7O15105 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMAD7O15105 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMAD7O15105 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMAD7O15105 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
SMAD7O15105 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
SMAD7O15105 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMAD7O15105 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SMAD7O15105 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMAD7O15105 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMAD7O15105 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMAD7O15105 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMAD7O15105 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMAD7O15105 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMAD7O15105 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMAD7O15105 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMAD7O15105 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMAD7O15105 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMAD7O15105 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMAD7O15105 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMAD7O15105 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMAD7O15105 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMAD7O15105 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMAD7O15105 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMAD7O15105 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMAD7O15105 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMAD7O15105 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMAD7O15105 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMAD7O15105 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMAD7O15105 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMAD7O15105 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMAD7O15105 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMAD7O15105 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMAD7O15105 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMAD7O15105 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMAD7O15105 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMAD7O15105 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMAD7O15105 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMAD7O15105 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SMAD7O15105 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SMAD7O15105 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMAD7O15105 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMAD7O15105 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMAD7O15105 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMAD7O15105 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMAD7O15105 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SMAD7O15105 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SMAD7O15105 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMAD7O15105 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMAD7O15105 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMAD7O15105 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMAD7O15105 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMAD7O15105 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMAD7O15105 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMAD7O15105 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMAD7O15105 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMAD7O15105 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMAD7O15105 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMAD7O15105 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMAD7O15105 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMAD7O15105 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SMAD7O15105 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms