Protein–RNA interactions for Protein: O14545

TRAFD1, TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 582 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAFD1O14545 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRAFD1O14545 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TRAFD1O14545 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TRAFD1O14545 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TRAFD1O14545 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TRAFD1O14545 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TRAFD1O14545 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TRAFD1O14545 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TRAFD1O14545 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TRAFD1O14545 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TRAFD1O14545 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TRAFD1O14545 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
TRAFD1O14545 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TRAFD1O14545 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TRAFD1O14545 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TRAFD1O14545 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
TRAFD1O14545 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TRAFD1O14545 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TRAFD1O14545 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TRAFD1O14545 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TRAFD1O14545 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TRAFD1O14545 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TRAFD1O14545 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TRAFD1O14545 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TRAFD1O14545 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TRAFD1O14545 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TRAFD1O14545 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TRAFD1O14545 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TRAFD1O14545 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TRAFD1O14545 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TRAFD1O14545 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TRAFD1O14545 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TRAFD1O14545 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TRAFD1O14545 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
TRAFD1O14545 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TRAFD1O14545 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
TRAFD1O14545 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
TRAFD1O14545 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRAFD1O14545 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRAFD1O14545 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRAFD1O14545 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRAFD1O14545 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRAFD1O14545 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRAFD1O14545 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRAFD1O14545 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRAFD1O14545 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRAFD1O14545 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRAFD1O14545 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRAFD1O14545 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRAFD1O14545 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRAFD1O14545 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRAFD1O14545 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRAFD1O14545 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRAFD1O14545 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRAFD1O14545 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRAFD1O14545 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRAFD1O14545 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRAFD1O14545 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRAFD1O14545 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRAFD1O14545 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRAFD1O14545 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRAFD1O14545 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRAFD1O14545 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRAFD1O14545 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRAFD1O14545 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRAFD1O14545 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRAFD1O14545 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
TRAFD1O14545 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRAFD1O14545 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRAFD1O14545 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
TRAFD1O14545 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
TRAFD1O14545 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRAFD1O14545 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
TRAFD1O14545 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRAFD1O14545 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRAFD1O14545 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRAFD1O14545 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRAFD1O14545 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRAFD1O14545 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TRAFD1O14545 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
TRAFD1O14545 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
TRAFD1O14545 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
TRAFD1O14545 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TRAFD1O14545 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TRAFD1O14545 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TRAFD1O14545 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
TRAFD1O14545 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRAFD1O14545 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRAFD1O14545 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRAFD1O14545 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
TRAFD1O14545 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRAFD1O14545 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRAFD1O14545 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRAFD1O14545 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRAFD1O14545 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRAFD1O14545 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRAFD1O14545 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRAFD1O14545 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRAFD1O14545 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
TRAFD1O14545 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
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