Protein–RNA interactions for Protein: O00635

TRIM38, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM38, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM38O00635 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRIM38O00635 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRIM38O00635 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRIM38O00635 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRIM38O00635 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRIM38O00635 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRIM38O00635 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRIM38O00635 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRIM38O00635 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRIM38O00635 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRIM38O00635 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRIM38O00635 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRIM38O00635 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRIM38O00635 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
TRIM38O00635 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRIM38O00635 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRIM38O00635 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRIM38O00635 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRIM38O00635 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRIM38O00635 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRIM38O00635 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRIM38O00635 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRIM38O00635 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRIM38O00635 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRIM38O00635 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRIM38O00635 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRIM38O00635 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TRIM38O00635 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TRIM38O00635 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
TRIM38O00635 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRIM38O00635 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRIM38O00635 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRIM38O00635 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRIM38O00635 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRIM38O00635 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRIM38O00635 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRIM38O00635 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRIM38O00635 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRIM38O00635 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRIM38O00635 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRIM38O00635 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRIM38O00635 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TRIM38O00635 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TRIM38O00635 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TRIM38O00635 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
TRIM38O00635 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRIM38O00635 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRIM38O00635 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRIM38O00635 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRIM38O00635 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRIM38O00635 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRIM38O00635 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRIM38O00635 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRIM38O00635 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRIM38O00635 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRIM38O00635 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRIM38O00635 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRIM38O00635 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRIM38O00635 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRIM38O00635 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRIM38O00635 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRIM38O00635 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRIM38O00635 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRIM38O00635 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRIM38O00635 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRIM38O00635 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRIM38O00635 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRIM38O00635 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRIM38O00635 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRIM38O00635 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRIM38O00635 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRIM38O00635 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRIM38O00635 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRIM38O00635 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TRIM38O00635 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TRIM38O00635 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRIM38O00635 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
TRIM38O00635 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRIM38O00635 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRIM38O00635 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRIM38O00635 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRIM38O00635 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRIM38O00635 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRIM38O00635 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRIM38O00635 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRIM38O00635 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRIM38O00635 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRIM38O00635 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
TRIM38O00635 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRIM38O00635 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRIM38O00635 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
TRIM38O00635 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRIM38O00635 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRIM38O00635 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRIM38O00635 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRIM38O00635 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRIM38O00635 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRIM38O00635 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRIM38O00635 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRIM38O00635 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms