Protein–RNA interactions for Protein: O00253

AGRP, Agouti-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 132 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGRPO00253 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
AGRPO00253 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
AGRPO00253 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
AGRPO00253 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
AGRPO00253 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
AGRPO00253 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
AGRPO00253 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
AGRPO00253 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
AGRPO00253 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
AGRPO00253 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
AGRPO00253 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
AGRPO00253 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
AGRPO00253 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
AGRPO00253 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
AGRPO00253 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
AGRPO00253 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
AGRPO00253 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
AGRPO00253 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
AGRPO00253 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
AGRPO00253 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
AGRPO00253 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
AGRPO00253 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
AGRPO00253 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
AGRPO00253 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
AGRPO00253 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
AGRPO00253 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
AGRPO00253 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
AGRPO00253 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
AGRPO00253 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
AGRPO00253 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
AGRPO00253 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
AGRPO00253 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
AGRPO00253 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
AGRPO00253 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
AGRPO00253 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
AGRPO00253 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
AGRPO00253 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
AGRPO00253 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
AGRPO00253 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
AGRPO00253 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
AGRPO00253 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
AGRPO00253 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
AGRPO00253 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
AGRPO00253 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
AGRPO00253 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
AGRPO00253 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
AGRPO00253 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
AGRPO00253 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
AGRPO00253 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
AGRPO00253 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
AGRPO00253 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
AGRPO00253 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
AGRPO00253 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
AGRPO00253 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
AGRPO00253 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
AGRPO00253 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
AGRPO00253 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
AGRPO00253 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
AGRPO00253 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
AGRPO00253 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
AGRPO00253 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
AGRPO00253 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
AGRPO00253 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
AGRPO00253 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
AGRPO00253 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
AGRPO00253 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
AGRPO00253 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
AGRPO00253 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
AGRPO00253 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
AGRPO00253 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
AGRPO00253 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
AGRPO00253 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
AGRPO00253 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
AGRPO00253 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
AGRPO00253 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
AGRPO00253 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
AGRPO00253 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
AGRPO00253 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
AGRPO00253 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
AGRPO00253 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
AGRPO00253 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
AGRPO00253 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
AGRPO00253 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
AGRPO00253 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
AGRPO00253 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
AGRPO00253 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
AGRPO00253 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
AGRPO00253 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
AGRPO00253 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
AGRPO00253 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
AGRPO00253 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
AGRPO00253 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
AGRPO00253 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
AGRPO00253 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
AGRPO00253 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
AGRPO00253 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
AGRPO00253 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
AGRPO00253 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
AGRPO00253 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
AGRPO00253 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.6 ms