Protein–RNA interactions for Protein: H3BQV0

KLRC4-KLRK1, KLRC4-KLRK1 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLRC4-KLRK1H3BQV0 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
KLRC4-KLRK1H3BQV0 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KLRC4-KLRK1H3BQV0 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KLRC4-KLRK1H3BQV0 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KLRC4-KLRK1H3BQV0 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KLRC4-KLRK1H3BQV0 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
KLRC4-KLRK1H3BQV0 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KLRC4-KLRK1H3BQV0 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KLRC4-KLRK1H3BQV0 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KLRC4-KLRK1H3BQV0 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KLRC4-KLRK1H3BQV0 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KLRC4-KLRK1H3BQV0 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KLRC4-KLRK1H3BQV0 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KLRC4-KLRK1H3BQV0 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KLRC4-KLRK1H3BQV0 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KLRC4-KLRK1H3BQV0 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KLRC4-KLRK1H3BQV0 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
KLRC4-KLRK1H3BQV0 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KLRC4-KLRK1H3BQV0 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KLRC4-KLRK1H3BQV0 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
KLRC4-KLRK1H3BQV0 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KLRC4-KLRK1H3BQV0 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KLRC4-KLRK1H3BQV0 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KLRC4-KLRK1H3BQV0 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KLRC4-KLRK1H3BQV0 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KLRC4-KLRK1H3BQV0 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KLRC4-KLRK1H3BQV0 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KLRC4-KLRK1H3BQV0 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KLRC4-KLRK1H3BQV0 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KLRC4-KLRK1H3BQV0 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KLRC4-KLRK1H3BQV0 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KLRC4-KLRK1H3BQV0 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KLRC4-KLRK1H3BQV0 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KLRC4-KLRK1H3BQV0 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
KLRC4-KLRK1H3BQV0 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KLRC4-KLRK1H3BQV0 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KLRC4-KLRK1H3BQV0 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KLRC4-KLRK1H3BQV0 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KLRC4-KLRK1H3BQV0 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KLRC4-KLRK1H3BQV0 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KLRC4-KLRK1H3BQV0 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
KLRC4-KLRK1H3BQV0 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KLRC4-KLRK1H3BQV0 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KLRC4-KLRK1H3BQV0 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KLRC4-KLRK1H3BQV0 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
KLRC4-KLRK1H3BQV0 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KLRC4-KLRK1H3BQV0 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KLRC4-KLRK1H3BQV0 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KLRC4-KLRK1H3BQV0 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KLRC4-KLRK1H3BQV0 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KLRC4-KLRK1H3BQV0 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KLRC4-KLRK1H3BQV0 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KLRC4-KLRK1H3BQV0 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KLRC4-KLRK1H3BQV0 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KLRC4-KLRK1H3BQV0 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KLRC4-KLRK1H3BQV0 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KLRC4-KLRK1H3BQV0 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KLRC4-KLRK1H3BQV0 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KLRC4-KLRK1H3BQV0 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KLRC4-KLRK1H3BQV0 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KLRC4-KLRK1H3BQV0 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KLRC4-KLRK1H3BQV0 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KLRC4-KLRK1H3BQV0 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KLRC4-KLRK1H3BQV0 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KLRC4-KLRK1H3BQV0 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KLRC4-KLRK1H3BQV0 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KLRC4-KLRK1H3BQV0 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KLRC4-KLRK1H3BQV0 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KLRC4-KLRK1H3BQV0 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
KLRC4-KLRK1H3BQV0 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KLRC4-KLRK1H3BQV0 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KLRC4-KLRK1H3BQV0 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KLRC4-KLRK1H3BQV0 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KLRC4-KLRK1H3BQV0 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KLRC4-KLRK1H3BQV0 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KLRC4-KLRK1H3BQV0 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KLRC4-KLRK1H3BQV0 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KLRC4-KLRK1H3BQV0 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KLRC4-KLRK1H3BQV0 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KLRC4-KLRK1H3BQV0 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KLRC4-KLRK1H3BQV0 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KLRC4-KLRK1H3BQV0 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KLRC4-KLRK1H3BQV0 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KLRC4-KLRK1H3BQV0 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KLRC4-KLRK1H3BQV0 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KLRC4-KLRK1H3BQV0 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KLRC4-KLRK1H3BQV0 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KLRC4-KLRK1H3BQV0 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KLRC4-KLRK1H3BQV0 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KLRC4-KLRK1H3BQV0 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
KLRC4-KLRK1H3BQV0 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KLRC4-KLRK1H3BQV0 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KLRC4-KLRK1H3BQV0 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KLRC4-KLRK1H3BQV0 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KLRC4-KLRK1H3BQV0 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KLRC4-KLRK1H3BQV0 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KLRC4-KLRK1H3BQV0 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KLRC4-KLRK1H3BQV0 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KLRC4-KLRK1H3BQV0 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KLRC4-KLRK1H3BQV0 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms