Protein–RNA interactions for Protein: H3BQV0

KLRC4-KLRK1, KLRC4-KLRK1 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 150 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLRC4-KLRK1H3BQV0 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
KLRC4-KLRK1H3BQV0 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KLRC4-KLRK1H3BQV0 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KLRC4-KLRK1H3BQV0 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KLRC4-KLRK1H3BQV0 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KLRC4-KLRK1H3BQV0 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
KLRC4-KLRK1H3BQV0 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KLRC4-KLRK1H3BQV0 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KLRC4-KLRK1H3BQV0 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KLRC4-KLRK1H3BQV0 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KLRC4-KLRK1H3BQV0 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KLRC4-KLRK1H3BQV0 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KLRC4-KLRK1H3BQV0 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KLRC4-KLRK1H3BQV0 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KLRC4-KLRK1H3BQV0 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KLRC4-KLRK1H3BQV0 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KLRC4-KLRK1H3BQV0 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
KLRC4-KLRK1H3BQV0 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KLRC4-KLRK1H3BQV0 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KLRC4-KLRK1H3BQV0 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
KLRC4-KLRK1H3BQV0 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KLRC4-KLRK1H3BQV0 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KLRC4-KLRK1H3BQV0 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KLRC4-KLRK1H3BQV0 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KLRC4-KLRK1H3BQV0 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KLRC4-KLRK1H3BQV0 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KLRC4-KLRK1H3BQV0 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KLRC4-KLRK1H3BQV0 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KLRC4-KLRK1H3BQV0 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KLRC4-KLRK1H3BQV0 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KLRC4-KLRK1H3BQV0 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KLRC4-KLRK1H3BQV0 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KLRC4-KLRK1H3BQV0 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KLRC4-KLRK1H3BQV0 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
KLRC4-KLRK1H3BQV0 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KLRC4-KLRK1H3BQV0 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KLRC4-KLRK1H3BQV0 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KLRC4-KLRK1H3BQV0 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KLRC4-KLRK1H3BQV0 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KLRC4-KLRK1H3BQV0 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KLRC4-KLRK1H3BQV0 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
KLRC4-KLRK1H3BQV0 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KLRC4-KLRK1H3BQV0 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KLRC4-KLRK1H3BQV0 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KLRC4-KLRK1H3BQV0 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
KLRC4-KLRK1H3BQV0 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KLRC4-KLRK1H3BQV0 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KLRC4-KLRK1H3BQV0 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KLRC4-KLRK1H3BQV0 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KLRC4-KLRK1H3BQV0 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KLRC4-KLRK1H3BQV0 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KLRC4-KLRK1H3BQV0 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KLRC4-KLRK1H3BQV0 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KLRC4-KLRK1H3BQV0 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KLRC4-KLRK1H3BQV0 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KLRC4-KLRK1H3BQV0 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KLRC4-KLRK1H3BQV0 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KLRC4-KLRK1H3BQV0 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KLRC4-KLRK1H3BQV0 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KLRC4-KLRK1H3BQV0 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KLRC4-KLRK1H3BQV0 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KLRC4-KLRK1H3BQV0 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KLRC4-KLRK1H3BQV0 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KLRC4-KLRK1H3BQV0 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KLRC4-KLRK1H3BQV0 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KLRC4-KLRK1H3BQV0 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KLRC4-KLRK1H3BQV0 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KLRC4-KLRK1H3BQV0 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KLRC4-KLRK1H3BQV0 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
KLRC4-KLRK1H3BQV0 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KLRC4-KLRK1H3BQV0 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KLRC4-KLRK1H3BQV0 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KLRC4-KLRK1H3BQV0 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KLRC4-KLRK1H3BQV0 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KLRC4-KLRK1H3BQV0 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KLRC4-KLRK1H3BQV0 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KLRC4-KLRK1H3BQV0 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KLRC4-KLRK1H3BQV0 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KLRC4-KLRK1H3BQV0 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KLRC4-KLRK1H3BQV0 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KLRC4-KLRK1H3BQV0 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KLRC4-KLRK1H3BQV0 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KLRC4-KLRK1H3BQV0 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KLRC4-KLRK1H3BQV0 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KLRC4-KLRK1H3BQV0 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KLRC4-KLRK1H3BQV0 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KLRC4-KLRK1H3BQV0 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KLRC4-KLRK1H3BQV0 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KLRC4-KLRK1H3BQV0 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KLRC4-KLRK1H3BQV0 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
KLRC4-KLRK1H3BQV0 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KLRC4-KLRK1H3BQV0 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KLRC4-KLRK1H3BQV0 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KLRC4-KLRK1H3BQV0 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KLRC4-KLRK1H3BQV0 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KLRC4-KLRK1H3BQV0 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KLRC4-KLRK1H3BQV0 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KLRC4-KLRK1H3BQV0 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KLRC4-KLRK1H3BQV0 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KLRC4-KLRK1H3BQV0 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.5 ms