Protein–RNA interactions for Protein: A6NGB9

WIPF3, WAS/WASL-interacting protein family member 3, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WIPF3A6NGB9 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
WIPF3A6NGB9 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
WIPF3A6NGB9 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
WIPF3A6NGB9 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
WIPF3A6NGB9 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
WIPF3A6NGB9 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
WIPF3A6NGB9 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
WIPF3A6NGB9 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
WIPF3A6NGB9 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
WIPF3A6NGB9 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
WIPF3A6NGB9 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
WIPF3A6NGB9 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
WIPF3A6NGB9 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
WIPF3A6NGB9 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
WIPF3A6NGB9 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
WIPF3A6NGB9 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
WIPF3A6NGB9 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
WIPF3A6NGB9 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
WIPF3A6NGB9 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
WIPF3A6NGB9 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
WIPF3A6NGB9 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
WIPF3A6NGB9 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
WIPF3A6NGB9 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
WIPF3A6NGB9 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
WIPF3A6NGB9 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
WIPF3A6NGB9 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
WIPF3A6NGB9 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
WIPF3A6NGB9 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
WIPF3A6NGB9 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
WIPF3A6NGB9 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
WIPF3A6NGB9 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
WIPF3A6NGB9 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
WIPF3A6NGB9 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
WIPF3A6NGB9 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
WIPF3A6NGB9 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
WIPF3A6NGB9 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
WIPF3A6NGB9 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
WIPF3A6NGB9 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
WIPF3A6NGB9 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
WIPF3A6NGB9 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
WIPF3A6NGB9 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
WIPF3A6NGB9 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
WIPF3A6NGB9 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
WIPF3A6NGB9 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
WIPF3A6NGB9 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
WIPF3A6NGB9 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
WIPF3A6NGB9 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
WIPF3A6NGB9 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
WIPF3A6NGB9 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
WIPF3A6NGB9 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
WIPF3A6NGB9 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
WIPF3A6NGB9 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
WIPF3A6NGB9 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
WIPF3A6NGB9 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
WIPF3A6NGB9 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
WIPF3A6NGB9 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
WIPF3A6NGB9 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
WIPF3A6NGB9 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
WIPF3A6NGB9 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
WIPF3A6NGB9 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
WIPF3A6NGB9 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
WIPF3A6NGB9 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
WIPF3A6NGB9 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
WIPF3A6NGB9 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
WIPF3A6NGB9 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
WIPF3A6NGB9 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
WIPF3A6NGB9 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
WIPF3A6NGB9 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
WIPF3A6NGB9 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
WIPF3A6NGB9 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
WIPF3A6NGB9 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
WIPF3A6NGB9 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
WIPF3A6NGB9 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
WIPF3A6NGB9 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
WIPF3A6NGB9 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
WIPF3A6NGB9 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
WIPF3A6NGB9 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
WIPF3A6NGB9 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
WIPF3A6NGB9 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
WIPF3A6NGB9 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
WIPF3A6NGB9 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
WIPF3A6NGB9 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
WIPF3A6NGB9 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
WIPF3A6NGB9 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
WIPF3A6NGB9 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
WIPF3A6NGB9 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
WIPF3A6NGB9 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
WIPF3A6NGB9 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
WIPF3A6NGB9 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
WIPF3A6NGB9 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
WIPF3A6NGB9 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
WIPF3A6NGB9 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
WIPF3A6NGB9 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
WIPF3A6NGB9 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
WIPF3A6NGB9 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
WIPF3A6NGB9 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
WIPF3A6NGB9 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
WIPF3A6NGB9 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
WIPF3A6NGB9 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
WIPF3A6NGB9 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms