Protein–RNA interactions for Protein: A5PLN9

TRAPPC13, Trafficking protein particle complex subunit 13, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC13A5PLN9 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRAPPC13A5PLN9 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRAPPC13A5PLN9 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRAPPC13A5PLN9 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRAPPC13A5PLN9 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRAPPC13A5PLN9 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRAPPC13A5PLN9 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRAPPC13A5PLN9 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRAPPC13A5PLN9 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRAPPC13A5PLN9 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRAPPC13A5PLN9 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRAPPC13A5PLN9 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRAPPC13A5PLN9 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRAPPC13A5PLN9 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRAPPC13A5PLN9 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRAPPC13A5PLN9 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRAPPC13A5PLN9 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRAPPC13A5PLN9 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRAPPC13A5PLN9 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TRAPPC13A5PLN9 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRAPPC13A5PLN9 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRAPPC13A5PLN9 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRAPPC13A5PLN9 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TRAPPC13A5PLN9 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRAPPC13A5PLN9 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRAPPC13A5PLN9 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRAPPC13A5PLN9 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRAPPC13A5PLN9 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRAPPC13A5PLN9 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRAPPC13A5PLN9 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TRAPPC13A5PLN9 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
TRAPPC13A5PLN9 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRAPPC13A5PLN9 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRAPPC13A5PLN9 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRAPPC13A5PLN9 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRAPPC13A5PLN9 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRAPPC13A5PLN9 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRAPPC13A5PLN9 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRAPPC13A5PLN9 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRAPPC13A5PLN9 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRAPPC13A5PLN9 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRAPPC13A5PLN9 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRAPPC13A5PLN9 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRAPPC13A5PLN9 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRAPPC13A5PLN9 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRAPPC13A5PLN9 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRAPPC13A5PLN9 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRAPPC13A5PLN9 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRAPPC13A5PLN9 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
TRAPPC13A5PLN9 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRAPPC13A5PLN9 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRAPPC13A5PLN9 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRAPPC13A5PLN9 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRAPPC13A5PLN9 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRAPPC13A5PLN9 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRAPPC13A5PLN9 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRAPPC13A5PLN9 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRAPPC13A5PLN9 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRAPPC13A5PLN9 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRAPPC13A5PLN9 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRAPPC13A5PLN9 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRAPPC13A5PLN9 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
TRAPPC13A5PLN9 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRAPPC13A5PLN9 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRAPPC13A5PLN9 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRAPPC13A5PLN9 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
TRAPPC13A5PLN9 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
TRAPPC13A5PLN9 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
TRAPPC13A5PLN9 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRAPPC13A5PLN9 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRAPPC13A5PLN9 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRAPPC13A5PLN9 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRAPPC13A5PLN9 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
TRAPPC13A5PLN9 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRAPPC13A5PLN9 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRAPPC13A5PLN9 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRAPPC13A5PLN9 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRAPPC13A5PLN9 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRAPPC13A5PLN9 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
TRAPPC13A5PLN9 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRAPPC13A5PLN9 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRAPPC13A5PLN9 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRAPPC13A5PLN9 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRAPPC13A5PLN9 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRAPPC13A5PLN9 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRAPPC13A5PLN9 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRAPPC13A5PLN9 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRAPPC13A5PLN9 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRAPPC13A5PLN9 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRAPPC13A5PLN9 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRAPPC13A5PLN9 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRAPPC13A5PLN9 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRAPPC13A5PLN9 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRAPPC13A5PLN9 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRAPPC13A5PLN9 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
TRAPPC13A5PLN9 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRAPPC13A5PLN9 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRAPPC13A5PLN9 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRAPPC13A5PLN9 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRAPPC13A5PLN9 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms