Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RQJ8

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0U1RQJ8 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
A0A0U1RQJ8 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
A0A0U1RQJ8 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
A0A0U1RQJ8 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
A0A0U1RQJ8 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.53■■■□□ 2
A0A0U1RQJ8 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
A0A0U1RQJ8 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
A0A0U1RQJ8 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
A0A0U1RQJ8 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
A0A0U1RQJ8 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
A0A0U1RQJ8 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
A0A0U1RQJ8 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
A0A0U1RQJ8 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
A0A0U1RQJ8 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
A0A0U1RQJ8 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
A0A0U1RQJ8 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
A0A0U1RQJ8 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
A0A0U1RQJ8 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
A0A0U1RQJ8 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
A0A0U1RQJ8 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
A0A0U1RQJ8 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
A0A0U1RQJ8 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
A0A0U1RQJ8 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
A0A0U1RQJ8 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
A0A0U1RQJ8 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
A0A0U1RQJ8 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
A0A0U1RQJ8 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
A0A0U1RQJ8 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
A0A0U1RQJ8 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
A0A0U1RQJ8 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
A0A0U1RQJ8 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
A0A0U1RQJ8 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
A0A0U1RQJ8 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
A0A0U1RQJ8 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
A0A0U1RQJ8 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
A0A0U1RQJ8 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
A0A0U1RQJ8 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
A0A0U1RQJ8 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
A0A0U1RQJ8 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
A0A0U1RQJ8 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
A0A0U1RQJ8 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
A0A0U1RQJ8 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
A0A0U1RQJ8 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
A0A0U1RQJ8 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
A0A0U1RQJ8 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
A0A0U1RQJ8 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
A0A0U1RQJ8 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
A0A0U1RQJ8 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
A0A0U1RQJ8 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
A0A0U1RQJ8 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
A0A0U1RQJ8 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
A0A0U1RQJ8 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
A0A0U1RQJ8 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
A0A0U1RQJ8 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
A0A0U1RQJ8 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
A0A0U1RQJ8 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
A0A0U1RQJ8 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
A0A0U1RQJ8 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
A0A0U1RQJ8 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
A0A0U1RQJ8 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC27.4■■□□□ 1.98
A0A0U1RQJ8 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
A0A0U1RQJ8 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
A0A0U1RQJ8 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
A0A0U1RQJ8 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
A0A0U1RQJ8 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
A0A0U1RQJ8 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
A0A0U1RQJ8 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
A0A0U1RQJ8 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
A0A0U1RQJ8 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
A0A0U1RQJ8 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
A0A0U1RQJ8 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
A0A0U1RQJ8 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
A0A0U1RQJ8 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
A0A0U1RQJ8 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
A0A0U1RQJ8 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
A0A0U1RQJ8 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
A0A0U1RQJ8 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
A0A0U1RQJ8 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
A0A0U1RQJ8 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
A0A0U1RQJ8 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
A0A0U1RQJ8 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
A0A0U1RQJ8 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
A0A0U1RQJ8 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
A0A0U1RQJ8 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
A0A0U1RQJ8 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
A0A0U1RQJ8 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
A0A0U1RQJ8 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
A0A0U1RQJ8 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
A0A0U1RQJ8 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
A0A0U1RQJ8 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
A0A0U1RQJ8 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
A0A0U1RQJ8 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
A0A0U1RQJ8 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
A0A0U1RQJ8 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
A0A0U1RQJ8 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
A0A0U1RQJ8 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
A0A0U1RQJ8 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
A0A0U1RQJ8 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
A0A0U1RQJ8 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
A0A0U1RQJ8 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms