Protein–RNA interactions for Protein: W5XKT8

SPACA6, Sperm acrosome membrane-associated protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 324 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPACA6W5XKT8 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SPACA6W5XKT8 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SPACA6W5XKT8 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SPACA6W5XKT8 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SPACA6W5XKT8 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SPACA6W5XKT8 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
SPACA6W5XKT8 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SPACA6W5XKT8 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SPACA6W5XKT8 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SPACA6W5XKT8 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SPACA6W5XKT8 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SPACA6W5XKT8 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SPACA6W5XKT8 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SPACA6W5XKT8 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SPACA6W5XKT8 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SPACA6W5XKT8 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SPACA6W5XKT8 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SPACA6W5XKT8 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SPACA6W5XKT8 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SPACA6W5XKT8 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SPACA6W5XKT8 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SPACA6W5XKT8 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SPACA6W5XKT8 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SPACA6W5XKT8 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SPACA6W5XKT8 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SPACA6W5XKT8 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SPACA6W5XKT8 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SPACA6W5XKT8 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SPACA6W5XKT8 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SPACA6W5XKT8 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SPACA6W5XKT8 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SPACA6W5XKT8 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SPACA6W5XKT8 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SPACA6W5XKT8 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SPACA6W5XKT8 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SPACA6W5XKT8 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SPACA6W5XKT8 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SPACA6W5XKT8 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SPACA6W5XKT8 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SPACA6W5XKT8 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SPACA6W5XKT8 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SPACA6W5XKT8 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
SPACA6W5XKT8 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
SPACA6W5XKT8 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SPACA6W5XKT8 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SPACA6W5XKT8 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SPACA6W5XKT8 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SPACA6W5XKT8 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SPACA6W5XKT8 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SPACA6W5XKT8 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SPACA6W5XKT8 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SPACA6W5XKT8 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SPACA6W5XKT8 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SPACA6W5XKT8 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SPACA6W5XKT8 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SPACA6W5XKT8 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SPACA6W5XKT8 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SPACA6W5XKT8 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SPACA6W5XKT8 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SPACA6W5XKT8 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SPACA6W5XKT8 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SPACA6W5XKT8 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SPACA6W5XKT8 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SPACA6W5XKT8 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SPACA6W5XKT8 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SPACA6W5XKT8 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
SPACA6W5XKT8 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SPACA6W5XKT8 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SPACA6W5XKT8 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SPACA6W5XKT8 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SPACA6W5XKT8 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SPACA6W5XKT8 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SPACA6W5XKT8 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SPACA6W5XKT8 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SPACA6W5XKT8 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SPACA6W5XKT8 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SPACA6W5XKT8 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SPACA6W5XKT8 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SPACA6W5XKT8 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SPACA6W5XKT8 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SPACA6W5XKT8 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SPACA6W5XKT8 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SPACA6W5XKT8 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SPACA6W5XKT8 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SPACA6W5XKT8 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SPACA6W5XKT8 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SPACA6W5XKT8 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SPACA6W5XKT8 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SPACA6W5XKT8 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SPACA6W5XKT8 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SPACA6W5XKT8 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SPACA6W5XKT8 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SPACA6W5XKT8 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SPACA6W5XKT8 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SPACA6W5XKT8 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SPACA6W5XKT8 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SPACA6W5XKT8 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SPACA6W5XKT8 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SPACA6W5XKT8 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SPACA6W5XKT8 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms