Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3T6

R3HCC1, R3H and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HCC1Q9Y3T6 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
R3HCC1Q9Y3T6 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
R3HCC1Q9Y3T6 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
R3HCC1Q9Y3T6 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
R3HCC1Q9Y3T6 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
R3HCC1Q9Y3T6 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
R3HCC1Q9Y3T6 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC29.21■■■□□ 2.27
R3HCC1Q9Y3T6 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC29.21■■■□□ 2.27
R3HCC1Q9Y3T6 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
R3HCC1Q9Y3T6 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
R3HCC1Q9Y3T6 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
R3HCC1Q9Y3T6 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
R3HCC1Q9Y3T6 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
R3HCC1Q9Y3T6 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
R3HCC1Q9Y3T6 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
R3HCC1Q9Y3T6 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
R3HCC1Q9Y3T6 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
R3HCC1Q9Y3T6 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
R3HCC1Q9Y3T6 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
R3HCC1Q9Y3T6 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
R3HCC1Q9Y3T6 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
R3HCC1Q9Y3T6 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
R3HCC1Q9Y3T6 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
R3HCC1Q9Y3T6 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
R3HCC1Q9Y3T6 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
R3HCC1Q9Y3T6 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
R3HCC1Q9Y3T6 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
R3HCC1Q9Y3T6 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
R3HCC1Q9Y3T6 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
R3HCC1Q9Y3T6 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
R3HCC1Q9Y3T6 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
R3HCC1Q9Y3T6 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
R3HCC1Q9Y3T6 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
R3HCC1Q9Y3T6 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
R3HCC1Q9Y3T6 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
R3HCC1Q9Y3T6 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
R3HCC1Q9Y3T6 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
R3HCC1Q9Y3T6 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
R3HCC1Q9Y3T6 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
R3HCC1Q9Y3T6 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
R3HCC1Q9Y3T6 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
R3HCC1Q9Y3T6 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
R3HCC1Q9Y3T6 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
R3HCC1Q9Y3T6 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
R3HCC1Q9Y3T6 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
R3HCC1Q9Y3T6 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
R3HCC1Q9Y3T6 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
R3HCC1Q9Y3T6 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
R3HCC1Q9Y3T6 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
R3HCC1Q9Y3T6 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
R3HCC1Q9Y3T6 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
R3HCC1Q9Y3T6 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
R3HCC1Q9Y3T6 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
R3HCC1Q9Y3T6 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
R3HCC1Q9Y3T6 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
R3HCC1Q9Y3T6 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
R3HCC1Q9Y3T6 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
R3HCC1Q9Y3T6 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
R3HCC1Q9Y3T6 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
R3HCC1Q9Y3T6 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
R3HCC1Q9Y3T6 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
R3HCC1Q9Y3T6 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
R3HCC1Q9Y3T6 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
R3HCC1Q9Y3T6 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
R3HCC1Q9Y3T6 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
R3HCC1Q9Y3T6 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
R3HCC1Q9Y3T6 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
R3HCC1Q9Y3T6 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
R3HCC1Q9Y3T6 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
R3HCC1Q9Y3T6 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
R3HCC1Q9Y3T6 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
R3HCC1Q9Y3T6 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
R3HCC1Q9Y3T6 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
R3HCC1Q9Y3T6 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
R3HCC1Q9Y3T6 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
R3HCC1Q9Y3T6 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
R3HCC1Q9Y3T6 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
R3HCC1Q9Y3T6 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
R3HCC1Q9Y3T6 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
R3HCC1Q9Y3T6 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
R3HCC1Q9Y3T6 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
R3HCC1Q9Y3T6 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
R3HCC1Q9Y3T6 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
R3HCC1Q9Y3T6 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
R3HCC1Q9Y3T6 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
R3HCC1Q9Y3T6 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
R3HCC1Q9Y3T6 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
R3HCC1Q9Y3T6 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
R3HCC1Q9Y3T6 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
R3HCC1Q9Y3T6 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
R3HCC1Q9Y3T6 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
R3HCC1Q9Y3T6 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
R3HCC1Q9Y3T6 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
R3HCC1Q9Y3T6 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
R3HCC1Q9Y3T6 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
R3HCC1Q9Y3T6 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
R3HCC1Q9Y3T6 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
R3HCC1Q9Y3T6 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
R3HCC1Q9Y3T6 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
R3HCC1Q9Y3T6 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms