Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK17

KCND3, Potassium voltage-gated channel subfamily D member 3, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCND3Q9UK17 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KCND3Q9UK17 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
KCND3Q9UK17 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
KCND3Q9UK17 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KCND3Q9UK17 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
KCND3Q9UK17 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KCND3Q9UK17 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
KCND3Q9UK17 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
KCND3Q9UK17 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
KCND3Q9UK17 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
KCND3Q9UK17 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KCND3Q9UK17 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
KCND3Q9UK17 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KCND3Q9UK17 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KCND3Q9UK17 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KCND3Q9UK17 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KCND3Q9UK17 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
KCND3Q9UK17 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KCND3Q9UK17 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KCND3Q9UK17 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
KCND3Q9UK17 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
KCND3Q9UK17 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KCND3Q9UK17 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KCND3Q9UK17 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KCND3Q9UK17 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KCND3Q9UK17 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
KCND3Q9UK17 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KCND3Q9UK17 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KCND3Q9UK17 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KCND3Q9UK17 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KCND3Q9UK17 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KCND3Q9UK17 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
KCND3Q9UK17 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KCND3Q9UK17 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
KCND3Q9UK17 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KCND3Q9UK17 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
KCND3Q9UK17 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
KCND3Q9UK17 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
KCND3Q9UK17 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KCND3Q9UK17 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
KCND3Q9UK17 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KCND3Q9UK17 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KCND3Q9UK17 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KCND3Q9UK17 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KCND3Q9UK17 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
KCND3Q9UK17 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
KCND3Q9UK17 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KCND3Q9UK17 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
KCND3Q9UK17 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KCND3Q9UK17 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KCND3Q9UK17 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KCND3Q9UK17 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KCND3Q9UK17 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
KCND3Q9UK17 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KCND3Q9UK17 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
KCND3Q9UK17 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
KCND3Q9UK17 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KCND3Q9UK17 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
KCND3Q9UK17 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KCND3Q9UK17 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
KCND3Q9UK17 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
KCND3Q9UK17 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
KCND3Q9UK17 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
KCND3Q9UK17 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
KCND3Q9UK17 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
KCND3Q9UK17 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
KCND3Q9UK17 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
KCND3Q9UK17 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
KCND3Q9UK17 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
KCND3Q9UK17 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
KCND3Q9UK17 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KCND3Q9UK17 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
KCND3Q9UK17 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KCND3Q9UK17 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KCND3Q9UK17 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KCND3Q9UK17 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KCND3Q9UK17 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KCND3Q9UK17 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KCND3Q9UK17 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KCND3Q9UK17 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KCND3Q9UK17 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KCND3Q9UK17 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KCND3Q9UK17 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KCND3Q9UK17 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KCND3Q9UK17 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
KCND3Q9UK17 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
KCND3Q9UK17 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
KCND3Q9UK17 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KCND3Q9UK17 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KCND3Q9UK17 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KCND3Q9UK17 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KCND3Q9UK17 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
KCND3Q9UK17 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KCND3Q9UK17 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
KCND3Q9UK17 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
KCND3Q9UK17 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
KCND3Q9UK17 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
KCND3Q9UK17 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KCND3Q9UK17 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KCND3Q9UK17 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms