Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBB5

MBD2, Methyl-CpG-binding domain protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD2Q9UBB5 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MBD2Q9UBB5 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
MBD2Q9UBB5 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MBD2Q9UBB5 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MBD2Q9UBB5 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MBD2Q9UBB5 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MBD2Q9UBB5 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MBD2Q9UBB5 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MBD2Q9UBB5 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MBD2Q9UBB5 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MBD2Q9UBB5 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MBD2Q9UBB5 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MBD2Q9UBB5 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MBD2Q9UBB5 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
MBD2Q9UBB5 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
MBD2Q9UBB5 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
MBD2Q9UBB5 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MBD2Q9UBB5 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MBD2Q9UBB5 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MBD2Q9UBB5 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MBD2Q9UBB5 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MBD2Q9UBB5 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MBD2Q9UBB5 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MBD2Q9UBB5 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MBD2Q9UBB5 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MBD2Q9UBB5 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MBD2Q9UBB5 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MBD2Q9UBB5 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MBD2Q9UBB5 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MBD2Q9UBB5 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MBD2Q9UBB5 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MBD2Q9UBB5 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MBD2Q9UBB5 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MBD2Q9UBB5 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MBD2Q9UBB5 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
MBD2Q9UBB5 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MBD2Q9UBB5 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MBD2Q9UBB5 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MBD2Q9UBB5 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MBD2Q9UBB5 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MBD2Q9UBB5 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MBD2Q9UBB5 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MBD2Q9UBB5 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MBD2Q9UBB5 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MBD2Q9UBB5 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MBD2Q9UBB5 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MBD2Q9UBB5 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MBD2Q9UBB5 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MBD2Q9UBB5 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MBD2Q9UBB5 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MBD2Q9UBB5 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MBD2Q9UBB5 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MBD2Q9UBB5 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MBD2Q9UBB5 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MBD2Q9UBB5 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MBD2Q9UBB5 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MBD2Q9UBB5 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MBD2Q9UBB5 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MBD2Q9UBB5 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MBD2Q9UBB5 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
MBD2Q9UBB5 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MBD2Q9UBB5 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MBD2Q9UBB5 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MBD2Q9UBB5 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MBD2Q9UBB5 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MBD2Q9UBB5 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MBD2Q9UBB5 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MBD2Q9UBB5 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MBD2Q9UBB5 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MBD2Q9UBB5 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MBD2Q9UBB5 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MBD2Q9UBB5 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MBD2Q9UBB5 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MBD2Q9UBB5 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MBD2Q9UBB5 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MBD2Q9UBB5 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MBD2Q9UBB5 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MBD2Q9UBB5 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MBD2Q9UBB5 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
MBD2Q9UBB5 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MBD2Q9UBB5 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MBD2Q9UBB5 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MBD2Q9UBB5 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MBD2Q9UBB5 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MBD2Q9UBB5 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MBD2Q9UBB5 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MBD2Q9UBB5 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MBD2Q9UBB5 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MBD2Q9UBB5 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MBD2Q9UBB5 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MBD2Q9UBB5 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MBD2Q9UBB5 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MBD2Q9UBB5 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
MBD2Q9UBB5 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MBD2Q9UBB5 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MBD2Q9UBB5 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MBD2Q9UBB5 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MBD2Q9UBB5 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MBD2Q9UBB5 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MBD2Q9UBB5 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms