Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E7

PCDH10, Protocadherin-10, humanhuman

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDH10Q9P2E7 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC29.33■■■□□ 2.29
PCDH10Q9P2E7 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
PCDH10Q9P2E7 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
PCDH10Q9P2E7 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
PCDH10Q9P2E7 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PCDH10Q9P2E7 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
PCDH10Q9P2E7 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
PCDH10Q9P2E7 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
PCDH10Q9P2E7 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
PCDH10Q9P2E7 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
PCDH10Q9P2E7 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
PCDH10Q9P2E7 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PCDH10Q9P2E7 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PCDH10Q9P2E7 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
PCDH10Q9P2E7 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PCDH10Q9P2E7 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
PCDH10Q9P2E7 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
PCDH10Q9P2E7 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
PCDH10Q9P2E7 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
PCDH10Q9P2E7 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PCDH10Q9P2E7 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PCDH10Q9P2E7 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
PCDH10Q9P2E7 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
PCDH10Q9P2E7 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
PCDH10Q9P2E7 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
PCDH10Q9P2E7 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
PCDH10Q9P2E7 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PCDH10Q9P2E7 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
PCDH10Q9P2E7 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
PCDH10Q9P2E7 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
PCDH10Q9P2E7 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC29.19■■■□□ 2.26
PCDH10Q9P2E7 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
PCDH10Q9P2E7 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
PCDH10Q9P2E7 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
PCDH10Q9P2E7 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PCDH10Q9P2E7 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PCDH10Q9P2E7 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
PCDH10Q9P2E7 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
PCDH10Q9P2E7 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
PCDH10Q9P2E7 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
PCDH10Q9P2E7 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
PCDH10Q9P2E7 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
PCDH10Q9P2E7 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PCDH10Q9P2E7 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC29.12■■■□□ 2.25
PCDH10Q9P2E7 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
PCDH10Q9P2E7 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PCDH10Q9P2E7 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PCDH10Q9P2E7 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PCDH10Q9P2E7 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PCDH10Q9P2E7 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
PCDH10Q9P2E7 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
PCDH10Q9P2E7 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
PCDH10Q9P2E7 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
PCDH10Q9P2E7 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PCDH10Q9P2E7 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PCDH10Q9P2E7 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PCDH10Q9P2E7 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PCDH10Q9P2E7 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PCDH10Q9P2E7 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
PCDH10Q9P2E7 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
PCDH10Q9P2E7 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
PCDH10Q9P2E7 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PCDH10Q9P2E7 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
PCDH10Q9P2E7 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
PCDH10Q9P2E7 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PCDH10Q9P2E7 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PCDH10Q9P2E7 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PCDH10Q9P2E7 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PCDH10Q9P2E7 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
PCDH10Q9P2E7 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
PCDH10Q9P2E7 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PCDH10Q9P2E7 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PCDH10Q9P2E7 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PCDH10Q9P2E7 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PCDH10Q9P2E7 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
PCDH10Q9P2E7 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
PCDH10Q9P2E7 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
PCDH10Q9P2E7 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PCDH10Q9P2E7 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
PCDH10Q9P2E7 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PCDH10Q9P2E7 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PCDH10Q9P2E7 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
PCDH10Q9P2E7 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
PCDH10Q9P2E7 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PCDH10Q9P2E7 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PCDH10Q9P2E7 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PCDH10Q9P2E7 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PCDH10Q9P2E7 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PCDH10Q9P2E7 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PCDH10Q9P2E7 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PCDH10Q9P2E7 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
PCDH10Q9P2E7 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
PCDH10Q9P2E7 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PCDH10Q9P2E7 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PCDH10Q9P2E7 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PCDH10Q9P2E7 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PCDH10Q9P2E7 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PCDH10Q9P2E7 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PCDH10Q9P2E7 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PCDH10Q9P2E7 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms