Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXH9

TRMT1, tRNA (guanine(26)-N(2))-dimethyltransferase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMT1Q9NXH9 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TRMT1Q9NXH9 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TRMT1Q9NXH9 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TRMT1Q9NXH9 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TRMT1Q9NXH9 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TRMT1Q9NXH9 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TRMT1Q9NXH9 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TRMT1Q9NXH9 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TRMT1Q9NXH9 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
TRMT1Q9NXH9 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TRMT1Q9NXH9 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TRMT1Q9NXH9 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TRMT1Q9NXH9 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TRMT1Q9NXH9 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TRMT1Q9NXH9 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TRMT1Q9NXH9 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TRMT1Q9NXH9 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TRMT1Q9NXH9 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TRMT1Q9NXH9 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TRMT1Q9NXH9 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TRMT1Q9NXH9 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TRMT1Q9NXH9 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
TRMT1Q9NXH9 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TRMT1Q9NXH9 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TRMT1Q9NXH9 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TRMT1Q9NXH9 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TRMT1Q9NXH9 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TRMT1Q9NXH9 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TRMT1Q9NXH9 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TRMT1Q9NXH9 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TRMT1Q9NXH9 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TRMT1Q9NXH9 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TRMT1Q9NXH9 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TRMT1Q9NXH9 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TRMT1Q9NXH9 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TRMT1Q9NXH9 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TRMT1Q9NXH9 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TRMT1Q9NXH9 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TRMT1Q9NXH9 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TRMT1Q9NXH9 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TRMT1Q9NXH9 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TRMT1Q9NXH9 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TRMT1Q9NXH9 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TRMT1Q9NXH9 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TRMT1Q9NXH9 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TRMT1Q9NXH9 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TRMT1Q9NXH9 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TRMT1Q9NXH9 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TRMT1Q9NXH9 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
TRMT1Q9NXH9 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.08
TRMT1Q9NXH9 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.08
TRMT1Q9NXH9 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
TRMT1Q9NXH9 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TRMT1Q9NXH9 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TRMT1Q9NXH9 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TRMT1Q9NXH9 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TRMT1Q9NXH9 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TRMT1Q9NXH9 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TRMT1Q9NXH9 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TRMT1Q9NXH9 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
TRMT1Q9NXH9 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC28■■■□□ 2.07
TRMT1Q9NXH9 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TRMT1Q9NXH9 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TRMT1Q9NXH9 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
TRMT1Q9NXH9 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TRMT1Q9NXH9 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TRMT1Q9NXH9 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TRMT1Q9NXH9 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TRMT1Q9NXH9 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TRMT1Q9NXH9 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TRMT1Q9NXH9 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TRMT1Q9NXH9 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TRMT1Q9NXH9 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TRMT1Q9NXH9 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TRMT1Q9NXH9 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TRMT1Q9NXH9 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TRMT1Q9NXH9 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TRMT1Q9NXH9 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
TRMT1Q9NXH9 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TRMT1Q9NXH9 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
TRMT1Q9NXH9 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
TRMT1Q9NXH9 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
TRMT1Q9NXH9 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TRMT1Q9NXH9 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TRMT1Q9NXH9 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TRMT1Q9NXH9 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TRMT1Q9NXH9 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TRMT1Q9NXH9 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TRMT1Q9NXH9 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TRMT1Q9NXH9 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TRMT1Q9NXH9 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TRMT1Q9NXH9 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TRMT1Q9NXH9 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TRMT1Q9NXH9 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TRMT1Q9NXH9 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TRMT1Q9NXH9 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
TRMT1Q9NXH9 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
TRMT1Q9NXH9 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
TRMT1Q9NXH9 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
TRMT1Q9NXH9 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.3 ms