Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ50

MRPL40, 39S ribosomal protein L40, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL40Q9NQ50 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
MRPL40Q9NQ50 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
MRPL40Q9NQ50 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
MRPL40Q9NQ50 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
MRPL40Q9NQ50 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
MRPL40Q9NQ50 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
MRPL40Q9NQ50 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
MRPL40Q9NQ50 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
MRPL40Q9NQ50 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.04■■□□□ 1.76
MRPL40Q9NQ50 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
MRPL40Q9NQ50 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
MRPL40Q9NQ50 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
MRPL40Q9NQ50 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
MRPL40Q9NQ50 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
MRPL40Q9NQ50 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
MRPL40Q9NQ50 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
MRPL40Q9NQ50 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
MRPL40Q9NQ50 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MRPL40Q9NQ50 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MRPL40Q9NQ50 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
MRPL40Q9NQ50 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
MRPL40Q9NQ50 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
MRPL40Q9NQ50 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
MRPL40Q9NQ50 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
MRPL40Q9NQ50 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
MRPL40Q9NQ50 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
MRPL40Q9NQ50 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
MRPL40Q9NQ50 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
MRPL40Q9NQ50 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
MRPL40Q9NQ50 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
MRPL40Q9NQ50 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
MRPL40Q9NQ50 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
MRPL40Q9NQ50 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
MRPL40Q9NQ50 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
MRPL40Q9NQ50 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
MRPL40Q9NQ50 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
MRPL40Q9NQ50 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
MRPL40Q9NQ50 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
MRPL40Q9NQ50 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
MRPL40Q9NQ50 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
MRPL40Q9NQ50 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
MRPL40Q9NQ50 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
MRPL40Q9NQ50 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
MRPL40Q9NQ50 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
MRPL40Q9NQ50 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
MRPL40Q9NQ50 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MRPL40Q9NQ50 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
MRPL40Q9NQ50 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
MRPL40Q9NQ50 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MRPL40Q9NQ50 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
MRPL40Q9NQ50 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
MRPL40Q9NQ50 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
MRPL40Q9NQ50 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
MRPL40Q9NQ50 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
MRPL40Q9NQ50 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
MRPL40Q9NQ50 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
MRPL40Q9NQ50 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
MRPL40Q9NQ50 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
MRPL40Q9NQ50 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
MRPL40Q9NQ50 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
MRPL40Q9NQ50 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
MRPL40Q9NQ50 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
MRPL40Q9NQ50 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
MRPL40Q9NQ50 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
MRPL40Q9NQ50 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
MRPL40Q9NQ50 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
MRPL40Q9NQ50 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
MRPL40Q9NQ50 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
MRPL40Q9NQ50 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
MRPL40Q9NQ50 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
MRPL40Q9NQ50 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
MRPL40Q9NQ50 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
MRPL40Q9NQ50 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MRPL40Q9NQ50 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
MRPL40Q9NQ50 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
MRPL40Q9NQ50 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
MRPL40Q9NQ50 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
MRPL40Q9NQ50 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MRPL40Q9NQ50 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
MRPL40Q9NQ50 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
MRPL40Q9NQ50 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MRPL40Q9NQ50 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MRPL40Q9NQ50 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MRPL40Q9NQ50 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
MRPL40Q9NQ50 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
MRPL40Q9NQ50 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
MRPL40Q9NQ50 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
MRPL40Q9NQ50 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MRPL40Q9NQ50 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MRPL40Q9NQ50 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MRPL40Q9NQ50 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MRPL40Q9NQ50 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
MRPL40Q9NQ50 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MRPL40Q9NQ50 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MRPL40Q9NQ50 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
MRPL40Q9NQ50 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
MRPL40Q9NQ50 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MRPL40Q9NQ50 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
MRPL40Q9NQ50 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MRPL40Q9NQ50 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms