Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCC0

MCCC2, Methylcrotonoyl-CoA carboxylase beta chain, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCCC2Q9HCC0 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MCCC2Q9HCC0 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MCCC2Q9HCC0 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MCCC2Q9HCC0 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MCCC2Q9HCC0 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MCCC2Q9HCC0 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
MCCC2Q9HCC0 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MCCC2Q9HCC0 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
MCCC2Q9HCC0 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
MCCC2Q9HCC0 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MCCC2Q9HCC0 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MCCC2Q9HCC0 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MCCC2Q9HCC0 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MCCC2Q9HCC0 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
MCCC2Q9HCC0 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MCCC2Q9HCC0 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
MCCC2Q9HCC0 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MCCC2Q9HCC0 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MCCC2Q9HCC0 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
MCCC2Q9HCC0 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MCCC2Q9HCC0 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MCCC2Q9HCC0 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MCCC2Q9HCC0 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
MCCC2Q9HCC0 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MCCC2Q9HCC0 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MCCC2Q9HCC0 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MCCC2Q9HCC0 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
MCCC2Q9HCC0 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
MCCC2Q9HCC0 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
MCCC2Q9HCC0 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MCCC2Q9HCC0 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MCCC2Q9HCC0 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MCCC2Q9HCC0 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MCCC2Q9HCC0 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MCCC2Q9HCC0 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MCCC2Q9HCC0 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MCCC2Q9HCC0 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MCCC2Q9HCC0 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MCCC2Q9HCC0 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MCCC2Q9HCC0 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MCCC2Q9HCC0 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MCCC2Q9HCC0 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MCCC2Q9HCC0 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MCCC2Q9HCC0 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
MCCC2Q9HCC0 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
MCCC2Q9HCC0 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MCCC2Q9HCC0 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
MCCC2Q9HCC0 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MCCC2Q9HCC0 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
MCCC2Q9HCC0 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MCCC2Q9HCC0 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MCCC2Q9HCC0 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MCCC2Q9HCC0 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MCCC2Q9HCC0 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MCCC2Q9HCC0 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MCCC2Q9HCC0 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MCCC2Q9HCC0 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MCCC2Q9HCC0 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MCCC2Q9HCC0 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MCCC2Q9HCC0 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MCCC2Q9HCC0 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MCCC2Q9HCC0 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MCCC2Q9HCC0 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MCCC2Q9HCC0 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MCCC2Q9HCC0 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MCCC2Q9HCC0 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MCCC2Q9HCC0 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MCCC2Q9HCC0 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MCCC2Q9HCC0 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
MCCC2Q9HCC0 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MCCC2Q9HCC0 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MCCC2Q9HCC0 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MCCC2Q9HCC0 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MCCC2Q9HCC0 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MCCC2Q9HCC0 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MCCC2Q9HCC0 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MCCC2Q9HCC0 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MCCC2Q9HCC0 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MCCC2Q9HCC0 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MCCC2Q9HCC0 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MCCC2Q9HCC0 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MCCC2Q9HCC0 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MCCC2Q9HCC0 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MCCC2Q9HCC0 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MCCC2Q9HCC0 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MCCC2Q9HCC0 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MCCC2Q9HCC0 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MCCC2Q9HCC0 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MCCC2Q9HCC0 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MCCC2Q9HCC0 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MCCC2Q9HCC0 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
MCCC2Q9HCC0 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MCCC2Q9HCC0 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MCCC2Q9HCC0 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MCCC2Q9HCC0 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MCCC2Q9HCC0 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MCCC2Q9HCC0 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MCCC2Q9HCC0 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MCCC2Q9HCC0 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MCCC2Q9HCC0 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms