Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC98

NEK6, Serine/threonine-protein kinase Nek6, humanhuman

Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEK6Q9HC98 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NEK6Q9HC98 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NEK6Q9HC98 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NEK6Q9HC98 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NEK6Q9HC98 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NEK6Q9HC98 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NEK6Q9HC98 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NEK6Q9HC98 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NEK6Q9HC98 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NEK6Q9HC98 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NEK6Q9HC98 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NEK6Q9HC98 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NEK6Q9HC98 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NEK6Q9HC98 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NEK6Q9HC98 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NEK6Q9HC98 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NEK6Q9HC98 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
NEK6Q9HC98 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NEK6Q9HC98 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NEK6Q9HC98 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NEK6Q9HC98 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NEK6Q9HC98 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NEK6Q9HC98 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NEK6Q9HC98 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NEK6Q9HC98 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NEK6Q9HC98 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NEK6Q9HC98 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
NEK6Q9HC98 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NEK6Q9HC98 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NEK6Q9HC98 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NEK6Q9HC98 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NEK6Q9HC98 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NEK6Q9HC98 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NEK6Q9HC98 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NEK6Q9HC98 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NEK6Q9HC98 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NEK6Q9HC98 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NEK6Q9HC98 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NEK6Q9HC98 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
NEK6Q9HC98 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NEK6Q9HC98 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NEK6Q9HC98 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
NEK6Q9HC98 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NEK6Q9HC98 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NEK6Q9HC98 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NEK6Q9HC98 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NEK6Q9HC98 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NEK6Q9HC98 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NEK6Q9HC98 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NEK6Q9HC98 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NEK6Q9HC98 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NEK6Q9HC98 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NEK6Q9HC98 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NEK6Q9HC98 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NEK6Q9HC98 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NEK6Q9HC98 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NEK6Q9HC98 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NEK6Q9HC98 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NEK6Q9HC98 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NEK6Q9HC98 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NEK6Q9HC98 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NEK6Q9HC98 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
NEK6Q9HC98 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NEK6Q9HC98 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NEK6Q9HC98 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NEK6Q9HC98 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NEK6Q9HC98 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NEK6Q9HC98 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NEK6Q9HC98 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NEK6Q9HC98 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NEK6Q9HC98 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NEK6Q9HC98 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NEK6Q9HC98 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NEK6Q9HC98 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NEK6Q9HC98 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NEK6Q9HC98 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NEK6Q9HC98 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NEK6Q9HC98 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NEK6Q9HC98 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NEK6Q9HC98 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NEK6Q9HC98 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NEK6Q9HC98 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NEK6Q9HC98 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NEK6Q9HC98 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NEK6Q9HC98 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NEK6Q9HC98 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NEK6Q9HC98 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NEK6Q9HC98 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NEK6Q9HC98 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NEK6Q9HC98 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NEK6Q9HC98 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NEK6Q9HC98 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NEK6Q9HC98 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NEK6Q9HC98 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
NEK6Q9HC98 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NEK6Q9HC98 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NEK6Q9HC98 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NEK6Q9HC98 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NEK6Q9HC98 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NEK6Q9HC98 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms