Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7F0

ATP13A3, Probable cation-transporting ATPase 13A3, humanhuman

Predictions only

Length 1,226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP13A3Q9H7F0 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ATP13A3Q9H7F0 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ATP13A3Q9H7F0 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ATP13A3Q9H7F0 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ATP13A3Q9H7F0 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ATP13A3Q9H7F0 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ATP13A3Q9H7F0 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
ATP13A3Q9H7F0 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ATP13A3Q9H7F0 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
ATP13A3Q9H7F0 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ATP13A3Q9H7F0 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ATP13A3Q9H7F0 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ATP13A3Q9H7F0 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ATP13A3Q9H7F0 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ATP13A3Q9H7F0 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ATP13A3Q9H7F0 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ATP13A3Q9H7F0 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ATP13A3Q9H7F0 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ATP13A3Q9H7F0 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ATP13A3Q9H7F0 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ATP13A3Q9H7F0 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ATP13A3Q9H7F0 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
ATP13A3Q9H7F0 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ATP13A3Q9H7F0 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ATP13A3Q9H7F0 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ATP13A3Q9H7F0 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
ATP13A3Q9H7F0 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ATP13A3Q9H7F0 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ATP13A3Q9H7F0 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ATP13A3Q9H7F0 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ATP13A3Q9H7F0 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ATP13A3Q9H7F0 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ATP13A3Q9H7F0 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ATP13A3Q9H7F0 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ATP13A3Q9H7F0 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
ATP13A3Q9H7F0 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ATP13A3Q9H7F0 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ATP13A3Q9H7F0 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ATP13A3Q9H7F0 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ATP13A3Q9H7F0 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ATP13A3Q9H7F0 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ATP13A3Q9H7F0 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ATP13A3Q9H7F0 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ATP13A3Q9H7F0 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
ATP13A3Q9H7F0 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ATP13A3Q9H7F0 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ATP13A3Q9H7F0 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ATP13A3Q9H7F0 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
ATP13A3Q9H7F0 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ATP13A3Q9H7F0 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ATP13A3Q9H7F0 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ATP13A3Q9H7F0 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ATP13A3Q9H7F0 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ATP13A3Q9H7F0 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ATP13A3Q9H7F0 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ATP13A3Q9H7F0 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ATP13A3Q9H7F0 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ATP13A3Q9H7F0 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ATP13A3Q9H7F0 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ATP13A3Q9H7F0 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ATP13A3Q9H7F0 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ATP13A3Q9H7F0 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ATP13A3Q9H7F0 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ATP13A3Q9H7F0 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ATP13A3Q9H7F0 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.76
ATP13A3Q9H7F0 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ATP13A3Q9H7F0 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ATP13A3Q9H7F0 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ATP13A3Q9H7F0 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ATP13A3Q9H7F0 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
ATP13A3Q9H7F0 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ATP13A3Q9H7F0 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ATP13A3Q9H7F0 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ATP13A3Q9H7F0 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ATP13A3Q9H7F0 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ATP13A3Q9H7F0 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ATP13A3Q9H7F0 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ATP13A3Q9H7F0 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ATP13A3Q9H7F0 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ATP13A3Q9H7F0 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
ATP13A3Q9H7F0 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
ATP13A3Q9H7F0 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ATP13A3Q9H7F0 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
ATP13A3Q9H7F0 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ATP13A3Q9H7F0 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ATP13A3Q9H7F0 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
ATP13A3Q9H7F0 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ATP13A3Q9H7F0 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
ATP13A3Q9H7F0 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ATP13A3Q9H7F0 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ATP13A3Q9H7F0 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
ATP13A3Q9H7F0 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
ATP13A3Q9H7F0 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
ATP13A3Q9H7F0 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26■■□□□ 1.75
ATP13A3Q9H7F0 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ATP13A3Q9H7F0 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ATP13A3Q9H7F0 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ATP13A3Q9H7F0 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ATP13A3Q9H7F0 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ATP13A3Q9H7F0 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.7 ms