Protein–RNA interactions for Protein: Q9H799

C5orf42, Protein JBTS17, humanhuman

Predictions only

Length 3,197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C5orf42Q9H799 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
C5orf42Q9H799 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
C5orf42Q9H799 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
C5orf42Q9H799 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
C5orf42Q9H799 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
C5orf42Q9H799 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
C5orf42Q9H799 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
C5orf42Q9H799 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
C5orf42Q9H799 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
C5orf42Q9H799 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
C5orf42Q9H799 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
C5orf42Q9H799 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
C5orf42Q9H799 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
C5orf42Q9H799 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC27.52■■■□□ 2
C5orf42Q9H799 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
C5orf42Q9H799 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
C5orf42Q9H799 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
C5orf42Q9H799 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
C5orf42Q9H799 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
C5orf42Q9H799 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
C5orf42Q9H799 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
C5orf42Q9H799 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
C5orf42Q9H799 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
C5orf42Q9H799 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
C5orf42Q9H799 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
C5orf42Q9H799 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
C5orf42Q9H799 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
C5orf42Q9H799 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
C5orf42Q9H799 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
C5orf42Q9H799 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
C5orf42Q9H799 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
C5orf42Q9H799 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
C5orf42Q9H799 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
C5orf42Q9H799 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
C5orf42Q9H799 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
C5orf42Q9H799 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
C5orf42Q9H799 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
C5orf42Q9H799 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
C5orf42Q9H799 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
C5orf42Q9H799 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
C5orf42Q9H799 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
C5orf42Q9H799 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
C5orf42Q9H799 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
C5orf42Q9H799 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
C5orf42Q9H799 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
C5orf42Q9H799 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
C5orf42Q9H799 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
C5orf42Q9H799 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
C5orf42Q9H799 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
C5orf42Q9H799 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
C5orf42Q9H799 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
C5orf42Q9H799 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
C5orf42Q9H799 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
C5orf42Q9H799 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
C5orf42Q9H799 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
C5orf42Q9H799 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
C5orf42Q9H799 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
C5orf42Q9H799 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
C5orf42Q9H799 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
C5orf42Q9H799 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
C5orf42Q9H799 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
C5orf42Q9H799 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
C5orf42Q9H799 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
C5orf42Q9H799 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
C5orf42Q9H799 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
C5orf42Q9H799 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
C5orf42Q9H799 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
C5orf42Q9H799 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
C5orf42Q9H799 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
C5orf42Q9H799 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
C5orf42Q9H799 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
C5orf42Q9H799 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
C5orf42Q9H799 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
C5orf42Q9H799 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
C5orf42Q9H799 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
C5orf42Q9H799 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
C5orf42Q9H799 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
C5orf42Q9H799 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
C5orf42Q9H799 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
C5orf42Q9H799 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
C5orf42Q9H799 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
C5orf42Q9H799 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
C5orf42Q9H799 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
C5orf42Q9H799 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
C5orf42Q9H799 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
C5orf42Q9H799 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
C5orf42Q9H799 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
C5orf42Q9H799 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
C5orf42Q9H799 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
C5orf42Q9H799 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
C5orf42Q9H799 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
C5orf42Q9H799 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
C5orf42Q9H799 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
C5orf42Q9H799 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
C5orf42Q9H799 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
C5orf42Q9H799 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
C5orf42Q9H799 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
C5orf42Q9H799 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
C5orf42Q9H799 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
C5orf42Q9H799 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms