Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2J4

PDCL3, Phosducin-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCL3Q9H2J4 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PDCL3Q9H2J4 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PDCL3Q9H2J4 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
PDCL3Q9H2J4 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
PDCL3Q9H2J4 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
PDCL3Q9H2J4 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
PDCL3Q9H2J4 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
PDCL3Q9H2J4 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PDCL3Q9H2J4 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PDCL3Q9H2J4 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PDCL3Q9H2J4 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PDCL3Q9H2J4 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
PDCL3Q9H2J4 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PDCL3Q9H2J4 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PDCL3Q9H2J4 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PDCL3Q9H2J4 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PDCL3Q9H2J4 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PDCL3Q9H2J4 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PDCL3Q9H2J4 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PDCL3Q9H2J4 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PDCL3Q9H2J4 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PDCL3Q9H2J4 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PDCL3Q9H2J4 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PDCL3Q9H2J4 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
PDCL3Q9H2J4 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
PDCL3Q9H2J4 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PDCL3Q9H2J4 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PDCL3Q9H2J4 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PDCL3Q9H2J4 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PDCL3Q9H2J4 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PDCL3Q9H2J4 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PDCL3Q9H2J4 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PDCL3Q9H2J4 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PDCL3Q9H2J4 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PDCL3Q9H2J4 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PDCL3Q9H2J4 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PDCL3Q9H2J4 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PDCL3Q9H2J4 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PDCL3Q9H2J4 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PDCL3Q9H2J4 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PDCL3Q9H2J4 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PDCL3Q9H2J4 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PDCL3Q9H2J4 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PDCL3Q9H2J4 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PDCL3Q9H2J4 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PDCL3Q9H2J4 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PDCL3Q9H2J4 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PDCL3Q9H2J4 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PDCL3Q9H2J4 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PDCL3Q9H2J4 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PDCL3Q9H2J4 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PDCL3Q9H2J4 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PDCL3Q9H2J4 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PDCL3Q9H2J4 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PDCL3Q9H2J4 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PDCL3Q9H2J4 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PDCL3Q9H2J4 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PDCL3Q9H2J4 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PDCL3Q9H2J4 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PDCL3Q9H2J4 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PDCL3Q9H2J4 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PDCL3Q9H2J4 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PDCL3Q9H2J4 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PDCL3Q9H2J4 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PDCL3Q9H2J4 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PDCL3Q9H2J4 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PDCL3Q9H2J4 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
PDCL3Q9H2J4 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PDCL3Q9H2J4 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PDCL3Q9H2J4 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PDCL3Q9H2J4 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PDCL3Q9H2J4 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PDCL3Q9H2J4 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PDCL3Q9H2J4 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PDCL3Q9H2J4 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PDCL3Q9H2J4 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PDCL3Q9H2J4 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PDCL3Q9H2J4 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PDCL3Q9H2J4 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PDCL3Q9H2J4 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PDCL3Q9H2J4 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PDCL3Q9H2J4 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PDCL3Q9H2J4 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PDCL3Q9H2J4 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
PDCL3Q9H2J4 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
PDCL3Q9H2J4 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
PDCL3Q9H2J4 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PDCL3Q9H2J4 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PDCL3Q9H2J4 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PDCL3Q9H2J4 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PDCL3Q9H2J4 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PDCL3Q9H2J4 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PDCL3Q9H2J4 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PDCL3Q9H2J4 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PDCL3Q9H2J4 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PDCL3Q9H2J4 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PDCL3Q9H2J4 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PDCL3Q9H2J4 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PDCL3Q9H2J4 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PDCL3Q9H2J4 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms