Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0F6

SHARPIN, Sharpin, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHARPINQ9H0F6 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SHARPINQ9H0F6 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SHARPINQ9H0F6 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SHARPINQ9H0F6 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SHARPINQ9H0F6 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SHARPINQ9H0F6 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SHARPINQ9H0F6 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SHARPINQ9H0F6 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SHARPINQ9H0F6 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SHARPINQ9H0F6 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SHARPINQ9H0F6 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SHARPINQ9H0F6 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SHARPINQ9H0F6 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SHARPINQ9H0F6 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SHARPINQ9H0F6 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SHARPINQ9H0F6 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SHARPINQ9H0F6 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SHARPINQ9H0F6 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SHARPINQ9H0F6 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SHARPINQ9H0F6 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SHARPINQ9H0F6 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SHARPINQ9H0F6 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SHARPINQ9H0F6 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SHARPINQ9H0F6 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SHARPINQ9H0F6 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SHARPINQ9H0F6 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SHARPINQ9H0F6 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SHARPINQ9H0F6 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SHARPINQ9H0F6 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SHARPINQ9H0F6 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SHARPINQ9H0F6 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SHARPINQ9H0F6 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SHARPINQ9H0F6 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SHARPINQ9H0F6 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SHARPINQ9H0F6 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SHARPINQ9H0F6 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SHARPINQ9H0F6 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SHARPINQ9H0F6 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SHARPINQ9H0F6 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SHARPINQ9H0F6 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SHARPINQ9H0F6 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SHARPINQ9H0F6 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SHARPINQ9H0F6 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SHARPINQ9H0F6 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SHARPINQ9H0F6 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SHARPINQ9H0F6 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SHARPINQ9H0F6 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SHARPINQ9H0F6 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SHARPINQ9H0F6 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SHARPINQ9H0F6 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SHARPINQ9H0F6 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SHARPINQ9H0F6 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SHARPINQ9H0F6 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SHARPINQ9H0F6 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SHARPINQ9H0F6 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SHARPINQ9H0F6 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SHARPINQ9H0F6 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SHARPINQ9H0F6 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SHARPINQ9H0F6 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SHARPINQ9H0F6 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SHARPINQ9H0F6 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SHARPINQ9H0F6 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SHARPINQ9H0F6 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SHARPINQ9H0F6 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SHARPINQ9H0F6 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SHARPINQ9H0F6 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SHARPINQ9H0F6 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SHARPINQ9H0F6 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SHARPINQ9H0F6 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SHARPINQ9H0F6 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SHARPINQ9H0F6 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SHARPINQ9H0F6 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SHARPINQ9H0F6 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SHARPINQ9H0F6 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SHARPINQ9H0F6 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SHARPINQ9H0F6 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SHARPINQ9H0F6 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SHARPINQ9H0F6 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SHARPINQ9H0F6 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SHARPINQ9H0F6 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SHARPINQ9H0F6 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SHARPINQ9H0F6 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SHARPINQ9H0F6 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SHARPINQ9H0F6 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SHARPINQ9H0F6 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SHARPINQ9H0F6 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SHARPINQ9H0F6 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SHARPINQ9H0F6 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SHARPINQ9H0F6 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SHARPINQ9H0F6 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SHARPINQ9H0F6 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SHARPINQ9H0F6 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SHARPINQ9H0F6 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SHARPINQ9H0F6 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SHARPINQ9H0F6 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SHARPINQ9H0F6 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SHARPINQ9H0F6 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SHARPINQ9H0F6 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SHARPINQ9H0F6 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SHARPINQ9H0F6 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1265.4 ms