Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0B9

ZCCHC2, Zinc finger CCHC domain-containing protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC2Q9C0B9 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ZCCHC2Q9C0B9 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ZCCHC2Q9C0B9 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ZCCHC2Q9C0B9 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ZCCHC2Q9C0B9 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ZCCHC2Q9C0B9 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ZCCHC2Q9C0B9 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ZCCHC2Q9C0B9 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ZCCHC2Q9C0B9 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ZCCHC2Q9C0B9 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ZCCHC2Q9C0B9 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
ZCCHC2Q9C0B9 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ZCCHC2Q9C0B9 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ZCCHC2Q9C0B9 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ZCCHC2Q9C0B9 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
ZCCHC2Q9C0B9 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ZCCHC2Q9C0B9 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ZCCHC2Q9C0B9 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ZCCHC2Q9C0B9 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ZCCHC2Q9C0B9 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ZCCHC2Q9C0B9 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ZCCHC2Q9C0B9 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ZCCHC2Q9C0B9 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ZCCHC2Q9C0B9 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ZCCHC2Q9C0B9 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
ZCCHC2Q9C0B9 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ZCCHC2Q9C0B9 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ZCCHC2Q9C0B9 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ZCCHC2Q9C0B9 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ZCCHC2Q9C0B9 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ZCCHC2Q9C0B9 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ZCCHC2Q9C0B9 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ZCCHC2Q9C0B9 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ZCCHC2Q9C0B9 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ZCCHC2Q9C0B9 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ZCCHC2Q9C0B9 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
ZCCHC2Q9C0B9 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ZCCHC2Q9C0B9 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ZCCHC2Q9C0B9 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ZCCHC2Q9C0B9 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
ZCCHC2Q9C0B9 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ZCCHC2Q9C0B9 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ZCCHC2Q9C0B9 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ZCCHC2Q9C0B9 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ZCCHC2Q9C0B9 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ZCCHC2Q9C0B9 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ZCCHC2Q9C0B9 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ZCCHC2Q9C0B9 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ZCCHC2Q9C0B9 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ZCCHC2Q9C0B9 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ZCCHC2Q9C0B9 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ZCCHC2Q9C0B9 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ZCCHC2Q9C0B9 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ZCCHC2Q9C0B9 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
ZCCHC2Q9C0B9 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ZCCHC2Q9C0B9 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ZCCHC2Q9C0B9 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZCCHC2Q9C0B9 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
ZCCHC2Q9C0B9 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZCCHC2Q9C0B9 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ZCCHC2Q9C0B9 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ZCCHC2Q9C0B9 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ZCCHC2Q9C0B9 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ZCCHC2Q9C0B9 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZCCHC2Q9C0B9 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZCCHC2Q9C0B9 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZCCHC2Q9C0B9 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZCCHC2Q9C0B9 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZCCHC2Q9C0B9 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ZCCHC2Q9C0B9 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ZCCHC2Q9C0B9 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ZCCHC2Q9C0B9 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZCCHC2Q9C0B9 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
ZCCHC2Q9C0B9 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZCCHC2Q9C0B9 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZCCHC2Q9C0B9 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZCCHC2Q9C0B9 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
ZCCHC2Q9C0B9 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZCCHC2Q9C0B9 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZCCHC2Q9C0B9 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ZCCHC2Q9C0B9 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ZCCHC2Q9C0B9 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ZCCHC2Q9C0B9 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZCCHC2Q9C0B9 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
ZCCHC2Q9C0B9 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZCCHC2Q9C0B9 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZCCHC2Q9C0B9 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZCCHC2Q9C0B9 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZCCHC2Q9C0B9 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZCCHC2Q9C0B9 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZCCHC2Q9C0B9 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZCCHC2Q9C0B9 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZCCHC2Q9C0B9 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZCCHC2Q9C0B9 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
ZCCHC2Q9C0B9 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZCCHC2Q9C0B9 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZCCHC2Q9C0B9 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZCCHC2Q9C0B9 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ZCCHC2Q9C0B9 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
ZCCHC2Q9C0B9 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms