Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVT8

TMUB1, Transmembrane and ubiquitin-like domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMUB1Q9BVT8 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMUB1Q9BVT8 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMUB1Q9BVT8 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMUB1Q9BVT8 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMUB1Q9BVT8 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMUB1Q9BVT8 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMUB1Q9BVT8 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMUB1Q9BVT8 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMUB1Q9BVT8 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMUB1Q9BVT8 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMUB1Q9BVT8 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMUB1Q9BVT8 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMUB1Q9BVT8 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMUB1Q9BVT8 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMUB1Q9BVT8 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMUB1Q9BVT8 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMUB1Q9BVT8 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMUB1Q9BVT8 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TMUB1Q9BVT8 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TMUB1Q9BVT8 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
TMUB1Q9BVT8 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TMUB1Q9BVT8 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TMUB1Q9BVT8 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TMUB1Q9BVT8 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMUB1Q9BVT8 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMUB1Q9BVT8 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMUB1Q9BVT8 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMUB1Q9BVT8 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TMUB1Q9BVT8 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMUB1Q9BVT8 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
TMUB1Q9BVT8 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMUB1Q9BVT8 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMUB1Q9BVT8 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMUB1Q9BVT8 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
TMUB1Q9BVT8 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMUB1Q9BVT8 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
TMUB1Q9BVT8 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMUB1Q9BVT8 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMUB1Q9BVT8 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMUB1Q9BVT8 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMUB1Q9BVT8 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMUB1Q9BVT8 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
TMUB1Q9BVT8 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMUB1Q9BVT8 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMUB1Q9BVT8 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMUB1Q9BVT8 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMUB1Q9BVT8 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMUB1Q9BVT8 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMUB1Q9BVT8 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMUB1Q9BVT8 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMUB1Q9BVT8 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMUB1Q9BVT8 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMUB1Q9BVT8 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMUB1Q9BVT8 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMUB1Q9BVT8 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMUB1Q9BVT8 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMUB1Q9BVT8 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMUB1Q9BVT8 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMUB1Q9BVT8 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMUB1Q9BVT8 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMUB1Q9BVT8 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMUB1Q9BVT8 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMUB1Q9BVT8 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMUB1Q9BVT8 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMUB1Q9BVT8 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMUB1Q9BVT8 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMUB1Q9BVT8 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMUB1Q9BVT8 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMUB1Q9BVT8 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMUB1Q9BVT8 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMUB1Q9BVT8 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMUB1Q9BVT8 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
TMUB1Q9BVT8 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
TMUB1Q9BVT8 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMUB1Q9BVT8 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMUB1Q9BVT8 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMUB1Q9BVT8 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMUB1Q9BVT8 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
TMUB1Q9BVT8 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMUB1Q9BVT8 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMUB1Q9BVT8 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMUB1Q9BVT8 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMUB1Q9BVT8 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMUB1Q9BVT8 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMUB1Q9BVT8 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMUB1Q9BVT8 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMUB1Q9BVT8 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMUB1Q9BVT8 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMUB1Q9BVT8 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMUB1Q9BVT8 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMUB1Q9BVT8 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMUB1Q9BVT8 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMUB1Q9BVT8 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TMUB1Q9BVT8 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TMUB1Q9BVT8 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
TMUB1Q9BVT8 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
TMUB1Q9BVT8 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMUB1Q9BVT8 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMUB1Q9BVT8 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMUB1Q9BVT8 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms