Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV73

CEP250, Centrosome-associated protein CEP250, humanhuman

Predictions only

Length 2,442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP250Q9BV73 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CEP250Q9BV73 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CEP250Q9BV73 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CEP250Q9BV73 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CEP250Q9BV73 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CEP250Q9BV73 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
CEP250Q9BV73 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
CEP250Q9BV73 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CEP250Q9BV73 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CEP250Q9BV73 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CEP250Q9BV73 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CEP250Q9BV73 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
CEP250Q9BV73 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CEP250Q9BV73 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CEP250Q9BV73 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CEP250Q9BV73 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CEP250Q9BV73 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CEP250Q9BV73 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
CEP250Q9BV73 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
CEP250Q9BV73 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CEP250Q9BV73 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CEP250Q9BV73 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CEP250Q9BV73 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CEP250Q9BV73 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CEP250Q9BV73 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CEP250Q9BV73 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CEP250Q9BV73 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CEP250Q9BV73 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CEP250Q9BV73 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CEP250Q9BV73 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CEP250Q9BV73 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
CEP250Q9BV73 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CEP250Q9BV73 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
CEP250Q9BV73 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CEP250Q9BV73 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CEP250Q9BV73 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CEP250Q9BV73 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CEP250Q9BV73 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CEP250Q9BV73 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CEP250Q9BV73 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CEP250Q9BV73 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CEP250Q9BV73 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CEP250Q9BV73 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CEP250Q9BV73 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CEP250Q9BV73 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CEP250Q9BV73 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CEP250Q9BV73 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CEP250Q9BV73 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
CEP250Q9BV73 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CEP250Q9BV73 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CEP250Q9BV73 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CEP250Q9BV73 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CEP250Q9BV73 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CEP250Q9BV73 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CEP250Q9BV73 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CEP250Q9BV73 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
CEP250Q9BV73 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CEP250Q9BV73 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CEP250Q9BV73 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CEP250Q9BV73 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CEP250Q9BV73 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CEP250Q9BV73 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CEP250Q9BV73 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CEP250Q9BV73 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CEP250Q9BV73 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CEP250Q9BV73 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CEP250Q9BV73 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CEP250Q9BV73 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CEP250Q9BV73 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CEP250Q9BV73 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CEP250Q9BV73 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CEP250Q9BV73 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CEP250Q9BV73 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CEP250Q9BV73 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CEP250Q9BV73 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CEP250Q9BV73 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CEP250Q9BV73 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CEP250Q9BV73 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
CEP250Q9BV73 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CEP250Q9BV73 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CEP250Q9BV73 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CEP250Q9BV73 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CEP250Q9BV73 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CEP250Q9BV73 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CEP250Q9BV73 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CEP250Q9BV73 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CEP250Q9BV73 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
CEP250Q9BV73 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CEP250Q9BV73 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CEP250Q9BV73 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
CEP250Q9BV73 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CEP250Q9BV73 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CEP250Q9BV73 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CEP250Q9BV73 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CEP250Q9BV73 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CEP250Q9BV73 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CEP250Q9BV73 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CEP250Q9BV73 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CEP250Q9BV73 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
CEP250Q9BV73 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 256.6 ms